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'''GRUPO DE MODELOS TEÓRICOS E COMPUTACIONAIS E LABORATÓRIO DE ESTRUTURAS CELULARES'''
''''''GRUPO DE MODELOS TEÓRICOS E COMPUTACIONAIS E LABORATÓRIO DE ESTRUTURAS CELULARES ''''''




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=== Pesquisadores Efetivos ===
=== Pesquisadores Efetivos ===


* Carolina Brito
* Daniel Gamermann
* Daniel Stariolo
* [http://www.if.ufrgs.br/~arenzon Jeferson Arenzon]
* Gilberto de Lima Thomas
* Gilberto de Lima Thomas
* [http://pcleon.if.ufrgs.br Leonardo Gregory Brunnet]
* [http://pcleon.if.ufrgs.br Leonardo Gregory Brunnet]
* [http://www.if.ufrgs.br/~idiart Marco Aurelio Pires Idiart]
* Mendeli Vainstein
* [[Rita M. C. Almeida]]
* [[Rita M. C. Almeida]]
* [http://www.if.ufrgs.br/~sgonc Sebastián Gonçalves]
* Sandra Prado
* Rubem Erichsen Jr
* Sérgio R. Souza


=== Colaboradores ===
=== Colaboradores ===
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* [http://www.ufsm.br/pgfisica/professor/mombach.html José Carlos Merino Mombach (UFPampa/UFSM)]
* [http://www.ufsm.br/pgfisica/professor/mombach.html José Carlos Merino Mombach (UFPampa/UFSM)]
* [http://www.if.ufrgs.br/~iglesias/JRIglesias_br.html José Roberto Iglesias (IF-UFRGS)]
* [http://www.if.ufrgs.br/~iglesias/JRIglesias_br.html José Roberto Iglesias (IF-UFRGS)]
* [http://www.if.ufrgs.br/cbrito/index.html Carolina Brito]
* [http://www.if.ufrgs.br/~arenzon Jeferson Arenzon]
* Raquel Giulian
* Rubem Erichsen Jr
* [http://www.if.ufrgs.br/~sgonc Sebastián Gonçalves]


=== Post-Docs ===
=== Post-Docs ===
* Carine Beatrici


=== Estudantes Doutorado ===
=== Estudantes Doutorado ===


* Beatriz Mizusaki
* Emanuel Fortes
* Gabriel Perrone
* Gabriel Perrone
* Isabela Berger
*[[Paulo Casagrande Godolphim]]
* Ismael Fortuna
* Gustavo Ourique
* Ricardo Melo Ferreira
* Guilherme Shoiti Yoshimatsu Giardini


=== Estudantes Mestrado ===
=== Estudantes Mestrado ===
* Alessandra Friederich Lutz
* Bernardo Boatini
* Eduarda Susin


=== Estudantes Iniciação Científica ===
=== Estudantes Iniciação Científica ===
* Paulo Furtado
* Manuela Barreto
* Nicole Narvaz
* Marcos Pasa
* Rafael Gandolfi Lanzini


* Aline Friederich Lutz
=== Laboratório de Estruturas Celulares ===
* Vinicius Moraes Faria
* Juliano Gianlupi


=== Equipes e Funções no Laboratório ===


* Aline, Isabela e Rodolfo - Manutenção de equipamentos.
 
* Jason - Autoclave  e soluções , almoxarifado e estoque.
Dispõe de variados equipamentos destinados a experimentos de regeneração e
motilidade celular. Desde 2004
diferentes linhagens de culturas de Hidras: normais, verdes ou geneticamente modificadas para fluorescer.
Equipamentos: microscopia
de campo claro, de contraste de fase e de fluorescência integrados a
um sistema de aquisição de dados feito no IF, estufa de CO2 para
manutenção de cultura de células, centrífuga, autoclave, banho Maria
termostático, Phgâmetro, capela de fluxo laminar bem como um sistema
de computadores para controle e análise de experimentos


== Linhas de Pesquisa ==
== Linhas de Pesquisa ==


* [[Segregação Celular]]
* [[Difusão e Armazenamento de Informação no Hipercubo: Redes Neurais e o Sistema Imunológico]]
* [[Difusão e Armazenamento de Informação no Hipercubo: Redes Neurais e o Sistema Imunológico]]
* [[Difusão de Substâncias Químicas em Estruturas Celulares]]
* [[Difusão de Substâncias Químicas em Estruturas Celulares]]
* [[Dinâmica de Epidemias]]
* [[Dinâmica de Epidemias]]
* [[Hydras e o Laboratório de Estruturas Celulares]]
* [[Laboratório de Estruturas Celulares]]
* [[Redes Aleatórias de Neurônios com Ruído]]
* [[Redes Aleatórias de Neurônios com Ruído]]
* [[Transição de vidro e propriedades de sólidos amorfos]]
* [[Transição de vidro e propriedades de sólidos amorfos]]
* [[Espumas]]
* [[Estudo sobre as equações mestras para redes que crescem]]
* [[Modelo Celular de Multi-partículas]]
* [[Biologia Quântica ]]


== Intercâmbio Científico ==
== Intercâmbio Científico ==
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* [http://cabfst28.cnea.gov.ar/~statisticalphysics/ Centro Atómico Bariloche - Argentina]
* [http://cabfst28.cnea.gov.ar/~statisticalphysics/ Centro Atómico Bariloche - Argentina]
* [http://www.cea.fr/ Commissariat a l'Energie Atomique, Saclay, França]
* [http://www.cea.fr/ Commissariat a l'Energie Atomique, Saclay, França]
* [http://www.iub.edu/ Indiana University - Bloomington, USA]
* [http://www.univ-paris-diderot.fr/english/ Université Paris Diderot - Paris 7, França]
* [http://www.ufrgs.br/biociencias/ Instituto de Biociências da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.ufrgs.br/biociencias/ Instituto de Biociências da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.cbiot.ufrgs.br/ Centro de Biotecnologia da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.inf.ufrgs.br/ Instituto de Informática da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.inf.ufrgs.br/ Instituto de Informática da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.lps.u-psud.fr/ Laboratoire de Physique des Solides de Orsay, França]
* [http://www.lps.u-psud.fr/ Laboratoire de Physique des Solides de Orsay, França]
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* [http://www.ufpe.br/ufpenova/ UFPE]
* [http://www.ufpe.br/ufpenova/ UFPE]
* [http://www.ufpr.br/portalufpr/ UFPR]
* [http://www.ufpr.br/portalufpr/ UFPR]
* [http://www.nd.edu/ University of Notre Dame, USA]
* [http://www.biologie.ens.fr/eceem/ Eco-Evolution Mathématique (IBENS, Paris) ]
* [http://www.ujf-grenoble.fr/ Université Joseph-Fourier, França]
 
==Seminários do Grupo MTC - atualizado em 2/12/22==
 
 
'''Os seminários ocorrerão às 2as.-feiras, 14h00, na sala do prédio O207'''.
<br/>
 
== Journal Club - Semetre 01/2016 ==
 
 
* PDF do seminario apresentado por Daniel Gamermann dia 25/5/2016:
[http://lief.if.ufrgs.br/pub/seminars/mtc/jorn.pdf 42-O Universo a vida e tudo mais]
[http://lief.if.ufrgs.br/pub/seminars/mtc/Phanerozoic_Biodiversity.svg.png Diversidade da vida no eon Fanerozóico]
 
== Vídeos de Apresentações do Grupo==
* [http://pcleon.if.ufrgs.br/pub/mtc/TCC_Bernardo_ed_221130.mp4 TCC-Bernardo-30/11/2022]
* [http://pcleon.if.ufrgs.br/pub/mtc/Pedro-Castel_230127.mp4 Pedro-Castel-Apresentação-Grupo-27/01/2023]


== Softwares ==
== Softwares ==


[http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/viacomplex/ Via Complex
* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/viacomplex/ Via Complex]
 
* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/transcriptogramer/ Transcriptogramer]
== Curso Cuda ==
== Curso Cuda ==


[http://docs.nvidia.com/cuda/ Documentação disponível]
* [http://docs.nvidia.com/cuda/ Documentação disponível]
 
[[Introdução]]


[[Comandos em C e em Fortran]]
* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/Cuda/ Curso IF-UFRGS - 2014/1]


== Getting started ==
== Getting started ==
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Edição atual tal como às 17h35min de 27 de março de 2024

'GRUPO DE MODELOS TEÓRICOS E COMPUTACIONAIS E LABORATÓRIO DE ESTRUTURAS CELULARES '


Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Instituto de Física - IF Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS PO Box 15051, 90501-970 Porto Alegre (RS), Brazil Telephone: 55 (51) 3308-7251 - Fax: 55 (51) 3308-1762

O grupo trabalha com modelagem computacional em sistemas extensos físicos e biológicos tais como espumas, estruturas celulares e dinâmica de epidemias. Há também linhas ativas em dinâmica de informação em redes: redes metabólicas e sua evolução, redes de neurônios, redes sociais e econofísica.

Pesquisadores Efetivos

Colaboradores

Post-Docs

  • Carine Beatrici

Estudantes Doutorado

Estudantes Mestrado

  • Bernardo Boatini

Estudantes Iniciação Científica

  • Paulo Furtado
  • Manuela Barreto
  • Nicole Narvaz
  • Marcos Pasa
  • Rafael Gandolfi Lanzini

Laboratório de Estruturas Celulares

Dispõe de variados equipamentos destinados a experimentos de regeneração e motilidade celular. Desde 2004 diferentes linhagens de culturas de Hidras: normais, verdes ou geneticamente modificadas para fluorescer. Equipamentos: microscopia de campo claro, de contraste de fase e de fluorescência integrados a um sistema de aquisição de dados feito no IF, estufa de CO2 para manutenção de cultura de células, centrífuga, autoclave, banho Maria termostático, Phgâmetro, capela de fluxo laminar bem como um sistema de computadores para controle e análise de experimentos

Linhas de Pesquisa

Intercâmbio Científico

Seminários do Grupo MTC - atualizado em 2/12/22

Os seminários ocorrerão às 2as.-feiras, 14h00, na sala do prédio O207.

Journal Club - Semetre 01/2016

  • PDF do seminario apresentado por Daniel Gamermann dia 25/5/2016:

42-O Universo a vida e tudo mais Diversidade da vida no eon Fanerozóico

Vídeos de Apresentações do Grupo

Softwares

Curso Cuda

Getting started

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Começando