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'GRUPO DE MODELOS TEÓRICOS E COMPUTACIONAIS E LABORATÓRIO DE ESTRUTURAS CELULARES '

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Instituto de Física - IF Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS PO Box 15051, 90501-970 Porto Alegre (RS), Brazil Telephone: 55 (51) 3308-7251 - Fax: 55 (51) 3308-1762

O grupo trabalha com modelagem computacional em sistemas extensos físicos e biológicos tais como espumas, estruturas celulares e dinâmica de epidemias. Há também linhas ativas em dinâmica de informação em redes: redes metabólicas e sua evolução, redes de neurônios, redes sociais e econofísica.

Pesquisadores Efetivos

• Daniel Gamermann
• Gilberto de Lima Thomas
• Leonardo Gregory Brunnet
• Mendeli Vainstein
• Rita M. C. Almeida

Colaboradores

• José Carlos Merino Mombach (UFPampa/UFSM)
• José Roberto Iglesias (IF-UFRGS)
• Carolina Brito
• Jeferson Arenzon
• Raquel Giulian
• Rubem Erichsen Jr
• Sebastián Gonçalves

Post-Docs

• Carine Beatrici

Estudantes Doutorado

• Beatriz Mizusaki
• Gabriel Perrone
• Ismael Fortuna
• Ricardo Melo Ferreira
• Samoel Renan Mello da Silva

Estudantes Mestrado

• Alessandra Friederich Lutz
• Eduarda Susin
• Juliano Gianlupi

Estudantes Iniciação Científica

• Aline Friederich Lütz
• Caroline Schmidt
• Cássio Kirch
• João Medeiros Dinis
• Paulo Casagrande Godolphim
• Pedro Inocêncio Rodrigues Terra
• Pricilla de Oliveira Henz
• Vítor Sudbrack

Laboratório de Estruturas Celulares

Dispõe de variados equipamentos destinados a experimentos de regeneração e motilidade celular. Desde 2004 diferentes linhagens de culturas de Hidras: normais, verdes ou geneticamente modificadas para fluorescer. Equipamentos: microscopia de campo claro, de contraste de fase e de fluorescência integrados a um sistema de aquisição de dados feito no IF, estufa de CO2 para manutenção de cultura de células, centrífuga, autoclave, banho Maria termostático, Phgâmetro, capela de fluxo laminar bem como um sistema de computadores para controle e análise de experimentos

Linhas de Pesquisa

• Segregação Celular
• Difusão e Armazenamento de Informação no Hipercubo: Redes Neurais e o Sistema Imunológico
• Difusão de Substâncias Químicas em Estruturas Celulares
• Dinâmica de Epidemias
• Laboratório de Estruturas Celulares
• Redes Aleatórias de Neurônios com Ruído
• Transição de vidro e propriedades de sólidos amorfos
• Espumas
• Estudo sobre as equações mestras para redes que crescem

Intercâmbio Científico

• Centro Atómico Bariloche - Argentina
• Commissariat a l'Energie Atomique, Saclay, França
• Indiana University - Bloomington, USA
• Université Paris Diderot - Paris 7, França
• Instituto de Biociências da UFRGS, Rio Grande do Sul
• Centro de Biotecnologia da UFRGS, Rio Grande do Sul
• Instituto de Informática da UFRGS, Rio Grande do Sul
• Laboratoire de Physique des Solides de Orsay, França
• UERGS
• UFF
• UFPE
• UFPR
• Eco-Evolution Mathématique (IBENS, Paris)

Seminários do Grupo MTC (FIP30150) - atualizado em 08/08/16

Os seminários ocorrerão às 4as.-feiras, 12h30, em alguma sala do prédio O.
A ordem de apresentação segue abaixo.

Nome	data	título
Juliano	10/ago
Samoel	17/ago
Caroline, Pedro Paulo e Guilherme	24/ago	Apres. SIC
João, Cássio Pricilla e José	31/ago	Apres. SIC
Vitor	21/set
Pricilla	28/set
Vinicius	05/out
Mendeli	19/out
Aline	26/out
Daniel	09/nov
Juliano	16/nov
Samoel	23/nov
Rita	30/nov
Vinicius	07/dez
Gilberto	14/dez
Leonardo	21/dez

Journal Club - Semetre 01/2016

• PDF do seminario apresentado por Daniel Gamermann dia 25/5/2016:

42-O Universo a vida e tudo mais Diversidade da vida no eon Fanerozóico

Workshop 2016

Sexta-feira: 8:30 - 9:00 - COFFEE BREAK

9:00 - 9:30 - Prof. Mendelli: "Dinâmica estocástica: modelos para migração celular"

9:30 - 10:00 - Aline

10:00 - 10:30 - COFFEE BREAK

10:30 - 11:00 - Pricilla: "EXPERIMENTOS DE VERIFICAÇÃO: MODELOS TEÓRICO E COMPUTACIONAL DE MIGRAÇÃO CELULAR"

11:00 - 11:30 - Gabriel

11:30 - 12:00 - Prof. Ricardo

12:00 - 13:30 - LUNCH BREAK

13:30 - 14:00 - Juliano: "Evolução de bolhas em um sistema simples"

14:00 - 14:30 - Guilherme: "Resumo Modelos de Langevin para mobilidade celular"

14:30 - 15:00 - Vítor: "Equação-mestra para a distribuição de grau de uma rede de Duplicação e Divergência"

15:00 -15:30 - Prof. Leonardo: "Estruturas auto-propelentes, segregação celular e difusão celular confinada: Status e perspectivas de Simulações e Experimentos"

15:30 -16:00 - COFFEE BREAK

16:00 - 16:30 - Samoel

16:30 - 17:00 - Cássio

17:00 - 17:30 - Prof. Gilberto

Sábado: 8:30 - 9:00 - COFFEE BREAK

9:00 - 9:30 - Prof. Rita: "Projeto de migração celular no MTC"

9:30 - 10:00 - João

10:00 - 10:30 - COFFEE BREAK

10:30 - 11:00 - Pedro: "Simulações computacionais de espumas em diversas frações lı́quidas"

11:00 - 11:30 - Paulo: "Mecanismos físicos mínimos nos movimentos de migração celular em diferentes geometrias: um experimento in silico de matéria ativa sujeita a restrições geométricas"

11:30 - 12:00 - Carol

12:00 - 12:30 - Prof. Daniel: "Analisando Dados do Governo"

Softwares

• Via Complex
• Transcriptogramer

Curso Cuda

• Documentação disponível

• Curso IF-UFRGS - 2014/1

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