Hydras e o Laboratório de Estruturas Celulares - Histórico de revisão

Kirch: Página substituída por '== Protocolos Utilizados == * Preparo da Solução DM (Meio de Dissociação) * Preparo da Solução HM (Meio favorável às Hidras) * Preparo do Alimento de...'

2015-01-05T15:26:42Z

Página substituída por '== Protocolos Utilizados == * Preparo da Solução DM (Meio de Dissociação) * Preparo da Solução HM (Meio favorável às Hidras) * Preparo do Alimento de...'

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	~~== '''2.3.1 Modelagem de segregação celular: animóides''' ==~~

	~~A partir da caracterização experimental da difusão celular como o mecanismo responsável pela segrega~~
	~~ção por Holtfreter em 1944 (Holtfreter1944) iniciou-se a discussão sobre a natureza desta difusão. E~~
	~~ntre as várias hipóteses levantadas, a “Hipótese da Adesão Diferenciada” (HAD), proposta em 1962 por~~
	M. S. Steinberg (Steinber1962), é a mais aceita atualmente. Segundo ela, dois ingredientes básicos regulam a segregação: motilidade e diferentes graus de adesão. Ao se difundirem devido à motilidade, a
	~~s células mais adesivas acabam formando um agregado central, com as células do tecido menos adesivo~~
	~~ficando no entorno.~~

	~~A simplicidade da hipótese é tentadora e levou à busca da origem da motilidade e das diferenças nas~~
	~~adesividades. Experimentos recentes confirmam alguns dos postulados da HAD: medidas de tensão superfici al~~
	~~em tecidos de embrião de aves (Foty1994) e a determinação da intensidade das forças de adesão entre~~
	~~pares de células de ''Hydra'' (Sato1994) confirmam as magnitudes das forças necessárias para o envolvimento~~
	~~dos tecidos. Além disso, várias caracterizações experimentais relacionadas com a difusão~~
	~~celular foram feitas: movimento celular induzido por flutuação da membrana celular (Mombach1995), movimento~~
	~~coerente de grupos de células (Rieu1998) e tempos característicos de aprisionamento diferenciados~~
	~~por tecido(Rieu2000).~~

	~~Esses resultados permitem-nos projetar modelagens computacionais quantitativas ou, pelo menos, semi-quantitativas.~~
	~~Neste contexto, Graner e Glazier(Graner1992) introduziram as primeiras simulações usando o~~
	~~modelo GGH(Glazier2006) e mostraram que a segregação pode ocorrer com as células mais adesivas sendo~~
	~~envolvidas pelas menos adesivas. No entanto, esta abordagem, além de ter sido feita apenas em duas dime~~
	~~nsões, não leva em consideração os movimentos coerentes de grupos de células constatados experiment~~
	~~almente, ou seja, não considera interações dependentes de velocidade.~~

	~~Nessa linha investigamos a dinâmica de segregação de células gerada a partir da competição entre os diversos mecanismos~~
	~~constatados experimentalmente: adesão diferencial, difusão browniana e movimentos coerentes de grupos de células. As questões~~
	~~aí formuladas são as seguintes: Existe universalidade associada ao processo de crescimento e segregação? Para que~~
	~~conjunto de parâmetros? Há alguma escala de tempo/tamanho onde um ou outro dos mecanismos domina?~~

	~~A resposta a essas perguntas passa pela construção de ferramentas de simulação e análise. De fato, todos os mecanismos~~
	~~detectados experimentalmente podem ser incluídos em modelos de partículas auto-propelentes - animóides - que se tornaram~~
	~~conhecidos não apenas na descrição de movimentos de grupos de animais(Vicsek1995), mas também na dinâmica de banhos de~~
	~~bactérias(Wu2000,Sokolov2007), em colônias de amebas e bactérias (Benjacob1995, Rieu2005), ou ainda em grupos de células~~
	~~movendo-se em um substrato, como melanócitos (Gruler1999).~~

	~~Nossos trabalhos iniciam com a construção ''ab initio'' de programas, em colaboração com H. Chaté do CEA-Saclay, visand~~
	~~o o estudo em duas dimensões de segregação celular em células de hidra e na construção do diagrama de fases do sistema~~
	~~com dois tipos distintos de animóides (Belmonte2007, Belmonte2008). Estamos buscando as relações entre parâmetros que p~~
	~~ropiciem a segregação, as escalas espaço-temporais onde ela ocorre e a existência, ou não, de universalidade no fenôme~~
	~~no. A mesma busca será feita em três dimensões quando a comparação com experimentos torna-se possível. Na parte experi~~
	~~mental contamos com a colaboração de J. P. Rieu da Université Claude Bernard de Lyon.~~

	~~As perguntas a serem respondida são~~

	~~# Como termos de interação dependentes de velocidade influenciam a segregação?~~
	~~# Como se dá a evolução espaço-temporal da segregação?~~
	~~# Como os resultados das simulações comparam-se com os dados experimentais?~~

	~~Pesquisadores: Leonardo G. Brunnet, Gilberto Lima Thomas e Rita M.C. de Almeida~~

	~~Estudantes: Carine Beatrici~~

	~~Colaboradores externos: Jean Paul Rieu, Hugues Chaté~~

	== Protocolos Utilizados ==		== Protocolos Utilizados ==

Kirch: /* 2.3.1 Modelagem de segregação celular: animóides */

2015-01-05T15:19:25Z

2.3.1 Modelagem de segregação celular: animóides

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	Pesquisadores: Leonardo G. Brunnet, Gilberto Lima Thomas e Rita M.C. de Almeida		Pesquisadores: Leonardo G. Brunnet, Gilberto Lima Thomas e Rita M.C. de Almeida

	Estudantes: Carine Beatrici ~~(Mestrado – Física)~~		Estudantes: Carine Beatrici

	Colaboradores externos: Jean Paul Rieu, Hugues Chaté		Colaboradores externos: Jean Paul Rieu, Hugues Chaté


	== Protocolos Utilizados ==		== Protocolos Utilizados ==

Nmallmann: /* Protocolos Utilizados */

2013-10-22T12:52:39Z

Protocolos Utilizados

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	== Protocolos Utilizados ==		== Protocolos Utilizados ==

	* [[Preparo da Solução DM (Meio ~~favorável às Hidras~~)]]		* [[Preparo da Solução DM (Meio de Dissociação)]]
	* [[Preparo da Solução HM (Meio ~~de Dissociação~~)]]		* [[Preparo da Solução HM (Meio favorável às Hidras)]]
	* [[Preparo do Alimento de Hidras (Artêmias)]]		* [[Preparo do Alimento de Hidras (Artêmias)]]

Nmallmann: Criou página com '== '''2.3.1 Modelagem de segregação celular: animóides''' == A partir da caracterização experimental da difusão celular como o mecanismo responsável pela segrega ção po...'

2013-10-22T12:49:18Z

Criou página com '== '''2.3.1 Modelagem de segregação celular: animóides''' == A partir da caracterização experimental da difusão celular como o mecanismo responsável pela segrega ção po...'

Página nova

== '''2.3.1 Modelagem de segregação celular: animóides''' ==

A partir da caracterização experimental da difusão celular como o mecanismo responsável pela segrega
ção por Holtfreter em 1944 (Holtfreter1944) iniciou-se a discussão sobre a natureza desta difusão. E
ntre as várias hipóteses levantadas, a “Hipótese da Adesão Diferenciada” (HAD), proposta em 1962 por
M. S. Steinberg (Steinber1962), é a mais aceita atualmente. Segundo ela, dois ingredientes básicos regulam a segregação: motilidade e diferentes graus de adesão. Ao se difundirem devido à motilidade, a
s células mais adesivas acabam formando um agregado central, com as células do tecido menos adesivo
ficando no entorno.

A simplicidade da hipótese é tentadora e levou à busca da origem da motilidade e das diferenças nas
adesividades. Experimentos recentes confirmam alguns dos postulados da HAD: medidas de tensão superfici al
em tecidos de embrião de aves (Foty1994) e a determinação da intensidade das forças de adesão entre
pares de células de ''Hydra'' (Sato1994) confirmam as magnitudes das forças necessárias para o envolvimento
dos tecidos. Além disso, várias caracterizações experimentais relacionadas com a difusão
celular foram feitas: movimento celular induzido por flutuação da membrana celular (Mombach1995), movimento
coerente de grupos de células (Rieu1998) e tempos característicos de aprisionamento diferenciados
por tecido(Rieu2000).

Esses resultados permitem-nos projetar modelagens computacionais quantitativas ou, pelo menos, semi-quantitativas.
Neste contexto, Graner e Glazier(Graner1992) introduziram as primeiras simulações usando o
modelo GGH(Glazier2006) e mostraram que a segregação pode ocorrer com as células mais adesivas sendo
envolvidas pelas menos adesivas. No entanto, esta abordagem, além de ter sido feita apenas em duas dime
nsões, não leva em consideração os movimentos coerentes de grupos de células constatados experiment
almente, ou seja, não considera interações dependentes de velocidade.

Nessa linha investigamos a dinâmica de segregação de células gerada a partir da competição entre os diversos mecanismos
constatados experimentalmente: adesão diferencial, difusão browniana e movimentos coerentes de grupos de células. As questões
aí formuladas são as seguintes: Existe universalidade associada ao processo de crescimento e segregação? Para que
conjunto de parâmetros? Há alguma escala de tempo/tamanho onde um ou outro dos mecanismos domina?

A resposta a essas perguntas passa pela construção de ferramentas de simulação e análise. De fato, todos os mecanismos
detectados experimentalmente podem ser incluídos em modelos de partículas auto-propelentes - animóides - que se tornaram
conhecidos não apenas na descrição de movimentos de grupos de animais(Vicsek1995), mas também na dinâmica de banhos de
bactérias(Wu2000,Sokolov2007), em colônias de amebas e bactérias (Benjacob1995, Rieu2005), ou ainda em grupos de células
movendo-se em um substrato, como melanócitos (Gruler1999).

Nossos trabalhos iniciam com a construção ''ab initio'' de programas, em colaboração com H. Chaté do CEA-Saclay, visand
o o estudo em duas dimensões de segregação celular em células de hidra e na construção do diagrama de fases do sistema
com dois tipos distintos de animóides (Belmonte2007, Belmonte2008). Estamos buscando as relações entre parâmetros que p
ropiciem a segregação, as escalas espaço-temporais onde ela ocorre e a existência, ou não, de universalidade no fenôme
no. A mesma busca será feita em três dimensões quando a comparação com experimentos torna-se possível. Na parte experi
mental contamos com a colaboração de J. P. Rieu da Université Claude Bernard de Lyon.

As perguntas a serem respondida são

# Como termos de interação dependentes de velocidade influenciam a segregação?
# Como se dá a evolução espaço-temporal da segregação?
# Como os resultados das simulações comparam-se com os dados experimentais?

Pesquisadores: Leonardo G. Brunnet, Gilberto Lima Thomas e Rita M.C. de Almeida

Estudantes: Carine Beatrici (Mestrado – Física)

Colaboradores externos: Jean Paul Rieu, Hugues Chaté

== Protocolos Utilizados ==

* [[Preparo da Solução DM (Meio favorável às Hidras)]]
* [[Preparo da Solução HM (Meio de Dissociação)]]
* [[Preparo do Alimento de Hidras (Artêmias)]]