MTC - Contribuições do usuário [pt-br]

Workshop 2016

2016-11-17T18:18:59Z

Vsud:

Local: Anfiteatro do prédio O.

Cronograma:

'''Sexta-feira, 18/11/2016:'''

9:00 - 9:30 - Prof. Mendelli: "Dinâmica estocástica: modelos para migração celular"

9:30 - 10:00 - Aline

10:00 - 10:30 - BREAK

10:30 - 11:00 - Pricilla: "EXPERIMENTOS DE VERIFICAÇÃO: MODELOS TEÓRICO E COMPUTACIONAL DE MIGRAÇÃO CELULAR"

11:00 - 11:30 - Gabriel

11:30 - 12:00 - Prof. Ricardo: "Soluções analíticas para o modelo de Barabási-Albert de crescimento de redes"

12:00 - 13:30 - BREAK

13:30 - 14:00 - Juliano: "Evolução de bolhas em um sistema simples"

14:00 - 14:30 - Guilherme: "Resumo Modelos de Langevin para mobilidade celular"

14:30 - 15:00 - Vítor: "Equação-mestra para a distribuição de grau de uma rede de Duplicação e Divergência"

15:00 -15:30 - Prof. Leonardo: "Estruturas auto-propelentes, segregação celular e difusão celular confinada: Status e perspectivas de Simulações e Experimentos"

15:30 -16:00 - BREAK

16:00 - 16:30 - Samoel

16:30 - 17:00 - Cássio

17:00 - 17:30 - Prof. Gilberto

'''Sábado, 19/11/2016:'''

9:00 - 9:30 - Prof. Rita: "Projeto de migração celular no MTC"

9:30 - 10:00 - João

10:00 - 10:30 - BREAK

10:30 - 11:00 - Pedro: "Simulações computacionais de espumas em diversas frações lı́quidas"

11:00 - 11:30 - Paulo: "Mecanismos físicos mínimos nos movimentos de migração celular em diferentes geometrias: um experimento in silico de matéria ativa sujeita a restrições geométricas"

11:30 - 12:00 - Carol

12:00 - 12:30 - Prof. Daniel: "Analisando Dados do Governo"

Workshop 2016

2016-11-17T18:17:11Z

Vsud:

Local: Anfiteatro do prédio O.

Cronograma:

'''Sexta-feira, 18/11/2016:'''

9:00 - 9:30 - Prof. Mendelli: "Dinâmica estocástica: modelos para migração celular"

9:30 - 10:00 - Aline

10:00 - 10:30 - BREAK

10:30 - 11:00 - Pricilla: "EXPERIMENTOS DE VERIFICAÇÃO: MODELOS TEÓRICO E COMPUTACIONAL DE MIGRAÇÃO CELULAR"

11:00 - 11:30 - Gabriel

11:30 - 12:00 - Prof. Ricardo

12:00 - 13:30 - BREAK

13:30 - 14:00 - Juliano: "Evolução de bolhas em um sistema simples"

14:00 - 14:30 - Guilherme: "Resumo Modelos de Langevin para mobilidade celular"

14:30 - 15:00 - Vítor: "Equação-mestra para a distribuição de grau de uma rede de Duplicação e Divergência"

15:00 -15:30 - Prof. Leonardo: "Estruturas auto-propelentes, segregação celular e difusão celular confinada: Status e perspectivas de Simulações e Experimentos"

15:30 -16:00 - BREAK

16:00 - 16:30 - Samoel

16:30 - 17:00 - Cássio

17:00 - 17:30 - Prof. Gilberto

'''Sábado, 19/11/2016:'''

9:00 - 9:30 - Prof. Rita: "Projeto de migração celular no MTC"

9:30 - 10:00 - João

10:00 - 10:30 - BREAK

10:30 - 11:00 - Pedro: "Simulações computacionais de espumas em diversas frações lı́quidas"

11:00 - 11:30 - Paulo: "Mecanismos físicos mínimos nos movimentos de migração celular em diferentes geometrias: um experimento in silico de matéria ativa sujeita a restrições geométricas"

11:30 - 12:00 - Carol

12:00 - 12:30 - Prof. Daniel: "Analisando Dados do Governo"

Workshop 2016

2016-11-17T18:15:35Z

Vsud: /* Workshop 2016 */

Local: Anfiteatro do prédio O.

Cronograma:

'''Sexta-feira, 18/11/2016:'''

8:30 - 9:00 - COFFEE BREAK

9:00 - 9:30 - Prof. Mendelli: "Dinâmica estocástica: modelos para migração celular"

9:30 - 10:00 - Aline

10:00 - 10:30 - COFFEE BREAK

10:30 - 11:00 - Pricilla: "EXPERIMENTOS DE VERIFICAÇÃO: MODELOS TEÓRICO E COMPUTACIONAL DE MIGRAÇÃO CELULAR"

11:00 - 11:30 - Gabriel

11:30 - 12:00 - Prof. Ricardo

12:00 - 13:30 - LUNCH BREAK

13:30 - 14:00 - Juliano: "Evolução de bolhas em um sistema simples"

14:00 - 14:30 - Guilherme: "Resumo Modelos de Langevin para mobilidade celular"

14:30 - 15:00 - Vítor: "Equação-mestra para a distribuição de grau de uma rede de Duplicação e Divergência"

15:00 -15:30 - Prof. Leonardo: "Estruturas auto-propelentes, segregação celular e difusão celular confinada: Status e perspectivas de Simulações e Experimentos"

15:30 -16:00 - COFFEE BREAK

16:00 - 16:30 - Samoel

16:30 - 17:00 - Cássio

17:00 - 17:30 - Prof. Gilberto

'''Sábado, 19/11/2016:'''

8:30 - 9:00 - COFFEE BREAK

9:00 - 9:30 - Prof. Rita: "Projeto de migração celular no MTC"

9:30 - 10:00 - João

10:00 - 10:30 - COFFEE BREAK

10:30 - 11:00 - Pedro: "Simulações computacionais de espumas em diversas frações lı́quidas"

11:00 - 11:30 - Paulo: "Mecanismos físicos mínimos nos movimentos de migração celular em diferentes geometrias: um experimento in silico de matéria ativa sujeita a restrições geométricas"

11:30 - 12:00 - Carol

12:00 - 12:30 - Prof. Daniel: "Analisando Dados do Governo"

Workshop 2016

2016-11-17T18:15:11Z

Vsud: Criou página com '== Workshop 2016 == '''Sexta-feira, 18/11/2016:''' 8:30 - 9:00 - COFFEE BREAK 9:00 - 9:30 - Prof. Mendelli: "Dinâmica estocástica: modelos para migração celular...'

== [[ Workshop 2016 ]] ==

'''Sexta-feira, 18/11/2016:'''

8:30 - 9:00 - COFFEE BREAK

9:00 - 9:30 - Prof. Mendelli: "Dinâmica estocástica: modelos para migração celular"

9:30 - 10:00 - Aline

10:00 - 10:30 - COFFEE BREAK

10:30 - 11:00 - Pricilla: "EXPERIMENTOS DE VERIFICAÇÃO: MODELOS TEÓRICO E COMPUTACIONAL DE MIGRAÇÃO CELULAR"

11:00 - 11:30 - Gabriel

11:30 - 12:00 - Prof. Ricardo

12:00 - 13:30 - LUNCH BREAK

13:30 - 14:00 - Juliano: "Evolução de bolhas em um sistema simples"

14:00 - 14:30 - Guilherme: "Resumo Modelos de Langevin para mobilidade celular"

14:30 - 15:00 - Vítor: "Equação-mestra para a distribuição de grau de uma rede de Duplicação e Divergência"

15:00 -15:30 - Prof. Leonardo: "Estruturas auto-propelentes, segregação celular e difusão celular confinada: Status e perspectivas de Simulações e Experimentos"

15:30 -16:00 - COFFEE BREAK

16:00 - 16:30 - Samoel

16:30 - 17:00 - Cássio

17:00 - 17:30 - Prof. Gilberto

'''Sábado, 19/11/2016:'''

8:30 - 9:00 - COFFEE BREAK

9:00 - 9:30 - Prof. Rita: "Projeto de migração celular no MTC"

9:30 - 10:00 - João

10:00 - 10:30 - COFFEE BREAK

10:30 - 11:00 - Pedro: "Simulações computacionais de espumas em diversas frações lı́quidas"

11:00 - 11:30 - Paulo: "Mecanismos físicos mínimos nos movimentos de migração celular em diferentes geometrias: um experimento in silico de matéria ativa sujeita a restrições geométricas"

11:30 - 12:00 - Carol

12:00 - 12:30 - Prof. Daniel: "Analisando Dados do Governo"

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2016-11-17T18:14:46Z

Vsud: /* Workshop 2016 */

''''''GRUPO DE MODELOS TEÓRICOS E COMPUTACIONAIS E LABORATÓRIO DE ESTRUTURAS CELULARES ''''''

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Instituto de Física - IF
Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS
PO Box 15051, 90501-970 Porto Alegre (RS), Brazil
Telephone: 55 (51) 3308-7251 - Fax: 55 (51) 3308-1762

O grupo trabalha com modelagem computacional em sistemas extensos físicos e biológicos tais como espumas, estruturas celulares e dinâmica de epidemias. Há também linhas ativas em dinâmica de informação em redes: redes metabólicas e sua evolução, redes de neurônios, redes sociais e econofísica.

=== Pesquisadores Efetivos ===

* Daniel Gamermann
* Gilberto de Lima Thomas
* [http://pcleon.if.ufrgs.br Leonardo Gregory Brunnet]
* Mendeli Vainstein
* [[Rita M. C. Almeida]]

=== Colaboradores ===

* [http://www.ufsm.br/pgfisica/professor/mombach.html José Carlos Merino Mombach (UFPampa/UFSM)]
* [http://www.if.ufrgs.br/~iglesias/JRIglesias_br.html José Roberto Iglesias (IF-UFRGS)]
* [http://www.if.ufrgs.br/cbrito/index.html Carolina Brito]
* [http://www.if.ufrgs.br/~arenzon Jeferson Arenzon]
* Raquel Giulian
* Rubem Erichsen Jr
* [http://www.if.ufrgs.br/~sgonc Sebastián Gonçalves]

=== Post-Docs ===
* Carine Beatrici

=== Estudantes Doutorado ===

* Beatriz Mizusaki
* Gabriel Perrone
* Ismael Fortuna
* Ricardo Melo Ferreira
* Samoel Renan Mello da Silva

=== Estudantes Mestrado ===
* Alessandra Friederich Lutz
* Eduarda Susin
* Juliano Gianlupi

=== Estudantes Iniciação Científica ===

* Aline Friederich Lütz
* Caroline Schmidt
* [[Cássio Kirch]]
* João Medeiros Dinis
* [[Paulo Casagrande Godolphim]]
* Pedro Inocêncio Rodrigues Terra
* Pricilla de Oliveira Henz
* Vítor Sudbrack

=== Laboratório de Estruturas Celulares ===

Dispõe de variados equipamentos destinados a experimentos de regeneração e
motilidade celular. Desde 2004
diferentes linhagens de culturas de Hidras: normais, verdes ou geneticamente modificadas para fluorescer.
Equipamentos: microscopia
de campo claro, de contraste de fase e de fluorescência integrados a
um sistema de aquisição de dados feito no IF, estufa de CO2 para
manutenção de cultura de células, centrífuga, autoclave, banho Maria
termostático, Phgâmetro, capela de fluxo laminar bem como um sistema
de computadores para controle e análise de experimentos

== Linhas de Pesquisa ==

* [[Segregação Celular]]
* [[Difusão e Armazenamento de Informação no Hipercubo: Redes Neurais e o Sistema Imunológico]]
* [[Difusão de Substâncias Químicas em Estruturas Celulares]]
* [[Dinâmica de Epidemias]]
* [[Laboratório de Estruturas Celulares]]
* [[Redes Aleatórias de Neurônios com Ruído]]
* [[Transição de vidro e propriedades de sólidos amorfos]]
* [[Espumas]]
* [[Estudo sobre as equações mestras para redes que crescem]]

== Intercâmbio Científico ==

* [http://cabfst28.cnea.gov.ar/~statisticalphysics/ Centro Atómico Bariloche - Argentina]
* [http://www.cea.fr/ Commissariat a l'Energie Atomique, Saclay, França]
* [http://www.iub.edu/ Indiana University - Bloomington, USA]
* [http://www.univ-paris-diderot.fr/english/ Université Paris Diderot - Paris 7, França]
* [http://www.ufrgs.br/biociencias/ Instituto de Biociências da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.cbiot.ufrgs.br/ Centro de Biotecnologia da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.inf.ufrgs.br/ Instituto de Informática da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.lps.u-psud.fr/ Laboratoire de Physique des Solides de Orsay, França]
* [http://www.uergs.edu.br/ UERGS]
* [http://www.uff.br/ UFF]
* [http://www.ufpe.br/ufpenova/ UFPE]
* [http://www.ufpr.br/portalufpr/ UFPR]
* [http://www.biologie.ens.fr/eceem/ Eco-Evolution Mathématique (IBENS, Paris) ]

==[[Seminários do Grupo MTC (FIP30150) - atualizado em 08/08/16]]==

'''Os seminários ocorrerão às 4as.-feiras, 12h30, em alguma sala do prédio O'''.
 
A ordem de apresentação segue abaixo.

{| class="wikitable"
|-
! scope="col" | Nome
! scope="col" | data
! scope="col" | título
|-
! scope="row"| Juliano
| 10/ago
|
|-
! scope="row"| Samoel
| 17/ago
|
|-
! scope="row" | Caroline, Pedro Paulo e Guilherme
| 24/ago
| Apres. SIC
|-
! scope="row" |João, Cássio Pricilla e José
| 31/ago
| Apres. SIC
|-
! scope="row"| Vitor
| 21/set
|
|-
! scope="row"| Pricilla
| 28/set
|
|-
! scope="row"| Vinicius
| 05/out
|
|-
! scope="row"| Mendeli
| 19/out
|
|-
! scope="row"| Aline
| 26/out
|
|-
! scope="row"| Daniel
| 09/nov
|
|-
! scope="row"| Juliano
| 16/nov
|
|-
! scope="row"| Samoel
| 23/nov
|
|-
! scope="row"| Rita
| 30/nov
|
|-
! scope="row"| Vinicius
| 07/dez
|
|-
! scope="row"| Gilberto
| 14/dez
|
|-
! scope="row"| Leonardo
| 21/dez
|
|}

== [[Journal Club - Semetre 01/2016]] ==

* PDF do seminario apresentado por Daniel Gamermann dia 25/5/2016:
[http://lief.if.ufrgs.br/pub/seminars/mtc/jorn.pdf 42-O Universo a vida e tudo mais]
[http://lief.if.ufrgs.br/pub/seminars/mtc/Phanerozoic_Biodiversity.svg.png Diversidade da vida no eon Fanerozóico]

== [[ Workshop 2016 ]] ==

'''Sexta-feira, 18/11/2016:'''

8:30 - 9:00 - COFFEE BREAK

9:00 - 9:30 - Prof. Mendelli: "Dinâmica estocástica: modelos para migração celular"

9:30 - 10:00 - Aline

10:00 - 10:30 - COFFEE BREAK

10:30 - 11:00 - Pricilla: "EXPERIMENTOS DE VERIFICAÇÃO: MODELOS TEÓRICO E COMPUTACIONAL DE MIGRAÇÃO CELULAR"

11:00 - 11:30 - Gabriel

11:30 - 12:00 - Prof. Ricardo

12:00 - 13:30 - LUNCH BREAK

13:30 - 14:00 - Juliano: "Evolução de bolhas em um sistema simples"

14:00 - 14:30 - Guilherme: "Resumo Modelos de Langevin para mobilidade celular"

14:30 - 15:00 - Vítor: "Equação-mestra para a distribuição de grau de uma rede de Duplicação e Divergência"

15:00 -15:30 - Prof. Leonardo: "Estruturas auto-propelentes, segregação celular e difusão celular confinada: Status e perspectivas de Simulações e Experimentos"

15:30 -16:00 - COFFEE BREAK

16:00 - 16:30 - Samoel

16:30 - 17:00 - Cássio

17:00 - 17:30 - Prof. Gilberto

'''Sábado, 19/11/2016:'''

8:30 - 9:00 - COFFEE BREAK

9:00 - 9:30 - Prof. Rita: "Projeto de migração celular no MTC"

9:30 - 10:00 - João

10:00 - 10:30 - COFFEE BREAK

10:30 - 11:00 - Pedro: "Simulações computacionais de espumas em diversas frações lı́quidas"

11:00 - 11:30 - Paulo: "Mecanismos físicos mínimos nos movimentos de migração celular em diferentes geometrias: um experimento in silico de matéria ativa sujeita a restrições geométricas"

11:30 - 12:00 - Carol

12:00 - 12:30 - Prof. Daniel: "Analisando Dados do Governo"

== [[Reunioes ]] ==

== Softwares ==

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/viacomplex/ Via Complex]
* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/transcriptogramer/ Transcriptogramer]
== Curso Cuda ==

* [http://docs.nvidia.com/cuda/ Documentação disponível]

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/Cuda/ Curso IF-UFRGS - 2014/1]

== Getting started ==
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:Configuration_settings Configuration settings list]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:FAQ MediaWiki FAQ]
* [http://mail.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce MediaWiki release mailing list]

Consult the [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents User's Guide] for information on using the wiki software.

<big>'''MediaWiki instalado com sucesso.'''</big>

Consulte o [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents Manual de Usuário] para informações de como usar o software wiki.

== Começando ==

* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:Configuration_settings Lista de opções de configuração]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:FAQ FAQ do MediaWiki]
* [https://lists.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce Lista de discussão com avisos de novas versões do MediaWiki]

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2016-11-17T18:13:43Z

Vsud: /* Workshop 2016 */

''''''GRUPO DE MODELOS TEÓRICOS E COMPUTACIONAIS E LABORATÓRIO DE ESTRUTURAS CELULARES ''''''

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Instituto de Física - IF
Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS
PO Box 15051, 90501-970 Porto Alegre (RS), Brazil
Telephone: 55 (51) 3308-7251 - Fax: 55 (51) 3308-1762

O grupo trabalha com modelagem computacional em sistemas extensos físicos e biológicos tais como espumas, estruturas celulares e dinâmica de epidemias. Há também linhas ativas em dinâmica de informação em redes: redes metabólicas e sua evolução, redes de neurônios, redes sociais e econofísica.

=== Pesquisadores Efetivos ===

* Daniel Gamermann
* Gilberto de Lima Thomas
* [http://pcleon.if.ufrgs.br Leonardo Gregory Brunnet]
* Mendeli Vainstein
* [[Rita M. C. Almeida]]

=== Colaboradores ===

* [http://www.ufsm.br/pgfisica/professor/mombach.html José Carlos Merino Mombach (UFPampa/UFSM)]
* [http://www.if.ufrgs.br/~iglesias/JRIglesias_br.html José Roberto Iglesias (IF-UFRGS)]
* [http://www.if.ufrgs.br/cbrito/index.html Carolina Brito]
* [http://www.if.ufrgs.br/~arenzon Jeferson Arenzon]
* Raquel Giulian
* Rubem Erichsen Jr
* [http://www.if.ufrgs.br/~sgonc Sebastián Gonçalves]

=== Post-Docs ===
* Carine Beatrici

=== Estudantes Doutorado ===

* Beatriz Mizusaki
* Gabriel Perrone
* Ismael Fortuna
* Ricardo Melo Ferreira
* Samoel Renan Mello da Silva

=== Estudantes Mestrado ===
* Alessandra Friederich Lutz
* Eduarda Susin
* Juliano Gianlupi

=== Estudantes Iniciação Científica ===

* Aline Friederich Lütz
* Caroline Schmidt
* [[Cássio Kirch]]
* João Medeiros Dinis
* [[Paulo Casagrande Godolphim]]
* Pedro Inocêncio Rodrigues Terra
* Pricilla de Oliveira Henz
* Vítor Sudbrack

=== Laboratório de Estruturas Celulares ===

Dispõe de variados equipamentos destinados a experimentos de regeneração e
motilidade celular. Desde 2004
diferentes linhagens de culturas de Hidras: normais, verdes ou geneticamente modificadas para fluorescer.
Equipamentos: microscopia
de campo claro, de contraste de fase e de fluorescência integrados a
um sistema de aquisição de dados feito no IF, estufa de CO2 para
manutenção de cultura de células, centrífuga, autoclave, banho Maria
termostático, Phgâmetro, capela de fluxo laminar bem como um sistema
de computadores para controle e análise de experimentos

== Linhas de Pesquisa ==

* [[Segregação Celular]]
* [[Difusão e Armazenamento de Informação no Hipercubo: Redes Neurais e o Sistema Imunológico]]
* [[Difusão de Substâncias Químicas em Estruturas Celulares]]
* [[Dinâmica de Epidemias]]
* [[Laboratório de Estruturas Celulares]]
* [[Redes Aleatórias de Neurônios com Ruído]]
* [[Transição de vidro e propriedades de sólidos amorfos]]
* [[Espumas]]
* [[Estudo sobre as equações mestras para redes que crescem]]

== Intercâmbio Científico ==

* [http://cabfst28.cnea.gov.ar/~statisticalphysics/ Centro Atómico Bariloche - Argentina]
* [http://www.cea.fr/ Commissariat a l'Energie Atomique, Saclay, França]
* [http://www.iub.edu/ Indiana University - Bloomington, USA]
* [http://www.univ-paris-diderot.fr/english/ Université Paris Diderot - Paris 7, França]
* [http://www.ufrgs.br/biociencias/ Instituto de Biociências da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.cbiot.ufrgs.br/ Centro de Biotecnologia da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.inf.ufrgs.br/ Instituto de Informática da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.lps.u-psud.fr/ Laboratoire de Physique des Solides de Orsay, França]
* [http://www.uergs.edu.br/ UERGS]
* [http://www.uff.br/ UFF]
* [http://www.ufpe.br/ufpenova/ UFPE]
* [http://www.ufpr.br/portalufpr/ UFPR]
* [http://www.biologie.ens.fr/eceem/ Eco-Evolution Mathématique (IBENS, Paris) ]

==[[Seminários do Grupo MTC (FIP30150) - atualizado em 08/08/16]]==

'''Os seminários ocorrerão às 4as.-feiras, 12h30, em alguma sala do prédio O'''.
 
A ordem de apresentação segue abaixo.

{| class="wikitable"
|-
! scope="col" | Nome
! scope="col" | data
! scope="col" | título
|-
! scope="row"| Juliano
| 10/ago
|
|-
! scope="row"| Samoel
| 17/ago
|
|-
! scope="row" | Caroline, Pedro Paulo e Guilherme
| 24/ago
| Apres. SIC
|-
! scope="row" |João, Cássio Pricilla e José
| 31/ago
| Apres. SIC
|-
! scope="row"| Vitor
| 21/set
|
|-
! scope="row"| Pricilla
| 28/set
|
|-
! scope="row"| Vinicius
| 05/out
|
|-
! scope="row"| Mendeli
| 19/out
|
|-
! scope="row"| Aline
| 26/out
|
|-
! scope="row"| Daniel
| 09/nov
|
|-
! scope="row"| Juliano
| 16/nov
|
|-
! scope="row"| Samoel
| 23/nov
|
|-
! scope="row"| Rita
| 30/nov
|
|-
! scope="row"| Vinicius
| 07/dez
|
|-
! scope="row"| Gilberto
| 14/dez
|
|-
! scope="row"| Leonardo
| 21/dez
|
|}

== [[Journal Club - Semetre 01/2016]] ==

* PDF do seminario apresentado por Daniel Gamermann dia 25/5/2016:
[http://lief.if.ufrgs.br/pub/seminars/mtc/jorn.pdf 42-O Universo a vida e tudo mais]
[http://lief.if.ufrgs.br/pub/seminars/mtc/Phanerozoic_Biodiversity.svg.png Diversidade da vida no eon Fanerozóico]

== [[ Workshop 2016 ]] ==

Sexta-feira:
8:30 - 9:00 - COFFEE BREAK

9:00 - 9:30 - Prof. Mendelli: "Dinâmica estocástica: modelos para migração celular"

9:30 - 10:00 - Aline

10:00 - 10:30 - COFFEE BREAK

10:30 - 11:00 - Pricilla: "EXPERIMENTOS DE VERIFICAÇÃO: MODELOS TEÓRICO E COMPUTACIONAL DE MIGRAÇÃO CELULAR"

11:00 - 11:30 - Gabriel

11:30 - 12:00 - Prof. Ricardo

12:00 - 13:30 - LUNCH BREAK

13:30 - 14:00 - Juliano: "Evolução de bolhas em um sistema simples"

14:00 - 14:30 - Guilherme: "Resumo Modelos de Langevin para mobilidade celular"

14:30 - 15:00 - Vítor: "Equação-mestra para a distribuição de grau de uma rede de Duplicação e Divergência"

15:00 -15:30 - Prof. Leonardo: "Estruturas auto-propelentes, segregação celular e difusão celular confinada: Status e perspectivas de Simulações e Experimentos"

15:30 -16:00 - COFFEE BREAK

16:00 - 16:30 - Samoel

16:30 - 17:00 - Cássio

17:00 - 17:30 - Prof. Gilberto

Sábado:
8:30 - 9:00 - COFFEE BREAK

9:00 - 9:30 - Prof. Rita: "Projeto de migração celular no MTC"

9:30 - 10:00 - João

10:00 - 10:30 - COFFEE BREAK

10:30 - 11:00 - Pedro: "Simulações computacionais de espumas em diversas frações lı́quidas"

11:00 - 11:30 - Paulo: "Mecanismos físicos mínimos nos movimentos de migração celular em diferentes geometrias: um experimento in silico de matéria ativa sujeita a restrições geométricas"

11:30 - 12:00 - Carol

12:00 - 12:30 - Prof. Daniel: "Analisando Dados do Governo"

== [[Reunioes ]] ==

== Softwares ==

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/viacomplex/ Via Complex]
* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/transcriptogramer/ Transcriptogramer]
== Curso Cuda ==

* [http://docs.nvidia.com/cuda/ Documentação disponível]

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/Cuda/ Curso IF-UFRGS - 2014/1]

== Getting started ==
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:Configuration_settings Configuration settings list]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:FAQ MediaWiki FAQ]
* [http://mail.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce MediaWiki release mailing list]

Consult the [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents User's Guide] for information on using the wiki software.

<big>'''MediaWiki instalado com sucesso.'''</big>

Consulte o [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents Manual de Usuário] para informações de como usar o software wiki.

== Começando ==

* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:Configuration_settings Lista de opções de configuração]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:FAQ FAQ do MediaWiki]
* [https://lists.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce Lista de discussão com avisos de novas versões do MediaWiki]

Página principal

2016-11-17T18:13:07Z

Vsud: /* Workshop 2016 */

''''''GRUPO DE MODELOS TEÓRICOS E COMPUTACIONAIS E LABORATÓRIO DE ESTRUTURAS CELULARES ''''''

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Instituto de Física - IF
Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS
PO Box 15051, 90501-970 Porto Alegre (RS), Brazil
Telephone: 55 (51) 3308-7251 - Fax: 55 (51) 3308-1762

O grupo trabalha com modelagem computacional em sistemas extensos físicos e biológicos tais como espumas, estruturas celulares e dinâmica de epidemias. Há também linhas ativas em dinâmica de informação em redes: redes metabólicas e sua evolução, redes de neurônios, redes sociais e econofísica.

=== Pesquisadores Efetivos ===

* Daniel Gamermann
* Gilberto de Lima Thomas
* [http://pcleon.if.ufrgs.br Leonardo Gregory Brunnet]
* Mendeli Vainstein
* [[Rita M. C. Almeida]]

=== Colaboradores ===

* [http://www.ufsm.br/pgfisica/professor/mombach.html José Carlos Merino Mombach (UFPampa/UFSM)]
* [http://www.if.ufrgs.br/~iglesias/JRIglesias_br.html José Roberto Iglesias (IF-UFRGS)]
* [http://www.if.ufrgs.br/cbrito/index.html Carolina Brito]
* [http://www.if.ufrgs.br/~arenzon Jeferson Arenzon]
* Raquel Giulian
* Rubem Erichsen Jr
* [http://www.if.ufrgs.br/~sgonc Sebastián Gonçalves]

=== Post-Docs ===
* Carine Beatrici

=== Estudantes Doutorado ===

* Beatriz Mizusaki
* Gabriel Perrone
* Ismael Fortuna
* Ricardo Melo Ferreira
* Samoel Renan Mello da Silva

=== Estudantes Mestrado ===
* Alessandra Friederich Lutz
* Eduarda Susin
* Juliano Gianlupi

=== Estudantes Iniciação Científica ===

* Aline Friederich Lütz
* Caroline Schmidt
* [[Cássio Kirch]]
* João Medeiros Dinis
* [[Paulo Casagrande Godolphim]]
* Pedro Inocêncio Rodrigues Terra
* Pricilla de Oliveira Henz
* Vítor Sudbrack

=== Laboratório de Estruturas Celulares ===

Dispõe de variados equipamentos destinados a experimentos de regeneração e
motilidade celular. Desde 2004
diferentes linhagens de culturas de Hidras: normais, verdes ou geneticamente modificadas para fluorescer.
Equipamentos: microscopia
de campo claro, de contraste de fase e de fluorescência integrados a
um sistema de aquisição de dados feito no IF, estufa de CO2 para
manutenção de cultura de células, centrífuga, autoclave, banho Maria
termostático, Phgâmetro, capela de fluxo laminar bem como um sistema
de computadores para controle e análise de experimentos

== Linhas de Pesquisa ==

* [[Segregação Celular]]
* [[Difusão e Armazenamento de Informação no Hipercubo: Redes Neurais e o Sistema Imunológico]]
* [[Difusão de Substâncias Químicas em Estruturas Celulares]]
* [[Dinâmica de Epidemias]]
* [[Laboratório de Estruturas Celulares]]
* [[Redes Aleatórias de Neurônios com Ruído]]
* [[Transição de vidro e propriedades de sólidos amorfos]]
* [[Espumas]]
* [[Estudo sobre as equações mestras para redes que crescem]]

== Intercâmbio Científico ==

* [http://cabfst28.cnea.gov.ar/~statisticalphysics/ Centro Atómico Bariloche - Argentina]
* [http://www.cea.fr/ Commissariat a l'Energie Atomique, Saclay, França]
* [http://www.iub.edu/ Indiana University - Bloomington, USA]
* [http://www.univ-paris-diderot.fr/english/ Université Paris Diderot - Paris 7, França]
* [http://www.ufrgs.br/biociencias/ Instituto de Biociências da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.cbiot.ufrgs.br/ Centro de Biotecnologia da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.inf.ufrgs.br/ Instituto de Informática da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.lps.u-psud.fr/ Laboratoire de Physique des Solides de Orsay, França]
* [http://www.uergs.edu.br/ UERGS]
* [http://www.uff.br/ UFF]
* [http://www.ufpe.br/ufpenova/ UFPE]
* [http://www.ufpr.br/portalufpr/ UFPR]
* [http://www.biologie.ens.fr/eceem/ Eco-Evolution Mathématique (IBENS, Paris) ]

==[[Seminários do Grupo MTC (FIP30150) - atualizado em 08/08/16]]==

'''Os seminários ocorrerão às 4as.-feiras, 12h30, em alguma sala do prédio O'''.
 
A ordem de apresentação segue abaixo.

{| class="wikitable"
|-
! scope="col" | Nome
! scope="col" | data
! scope="col" | título
|-
! scope="row"| Juliano
| 10/ago
|
|-
! scope="row"| Samoel
| 17/ago
|
|-
! scope="row" | Caroline, Pedro Paulo e Guilherme
| 24/ago
| Apres. SIC
|-
! scope="row" |João, Cássio Pricilla e José
| 31/ago
| Apres. SIC
|-
! scope="row"| Vitor
| 21/set
|
|-
! scope="row"| Pricilla
| 28/set
|
|-
! scope="row"| Vinicius
| 05/out
|
|-
! scope="row"| Mendeli
| 19/out
|
|-
! scope="row"| Aline
| 26/out
|
|-
! scope="row"| Daniel
| 09/nov
|
|-
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| 16/nov
|
|-
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| 23/nov
|
|-
! scope="row"| Rita
| 30/nov
|
|-
! scope="row"| Vinicius
| 07/dez
|
|-
! scope="row"| Gilberto
| 14/dez
|
|-
! scope="row"| Leonardo
| 21/dez
|
|}

== [[Journal Club - Semetre 01/2016]] ==

* PDF do seminario apresentado por Daniel Gamermann dia 25/5/2016:
[http://lief.if.ufrgs.br/pub/seminars/mtc/jorn.pdf 42-O Universo a vida e tudo mais]
[http://lief.if.ufrgs.br/pub/seminars/mtc/Phanerozoic_Biodiversity.svg.png Diversidade da vida no eon Fanerozóico]

== [[ Workshop 2016 ]] ==

Sexta-feira:
8:30 - 9:00 - COFFEE BREAK
9:00 - 9:30 - Prof. Mendelli: "Dinâmica estocástica: modelos para migração celular"
9:30 - 10:00 - Aline
10:00 - 10:30 - COFFEE BREAK
10:30 - 11:00 - Pricilla: "EXPERIMENTOS DE VERIFICAÇÃO: MODELOS TEÓRICO E COMPUTACIONAL DE MIGRAÇÃO CELULAR"
11:00 - 11:30 - Gabriel
11:30 - 12:00 - Prof. Ricardo
12:00 - 13:30 - LUNCH BREAK
13:30 - 14:00 - Juliano: "Evolução de bolhas em um sistema simples"
14:00 - 14:30 - Guilherme: "Resumo Modelos de Langevin para mobilidade celular"
14:30 - 15:00 - Vítor: "Equação-mestra para a distribuição de grau de uma rede de Duplicação e Divergência"
15:00 -15:30 - Prof. Leonardo: "Estruturas auto-propelentes, segregação celular e difusão celular confinada: Status e perspectivas de Simulações e Experimentos"
15:30 -16:00 - COFFEE BREAK
16:00 - 16:30 - Samoel
16:30 - 17:00 - Cássio
17:00 - 17:30 - Prof. Gilberto

Sábado:
8:30 - 9:00 - COFFEE BREAK
9:00 - 9:30 - Prof. Rita: "Projeto de migração celular no MTC"
9:30 - 10:00 - João
10:00 - 10:30 - COFFEE BREAK
10:30 - 11:00 - Pedro: "Simulações computacionais de espumas em diversas frações lı́quidas"
11:00 - 11:30 - Paulo: "Mecanismos físicos mínimos nos movimentos de migração celular em diferentes geometrias: um experimento in silico de matéria ativa sujeita a restrições geométricas"
11:30 - 12:00 - Carol
12:00 - 12:30 - Prof. Daniel: "Analisando Dados do Governo"

== [[Reunioes ]] ==

== Softwares ==

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/viacomplex/ Via Complex]
* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/transcriptogramer/ Transcriptogramer]
== Curso Cuda ==

* [http://docs.nvidia.com/cuda/ Documentação disponível]

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/Cuda/ Curso IF-UFRGS - 2014/1]

== Getting started ==
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:Configuration_settings Configuration settings list]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:FAQ MediaWiki FAQ]
* [http://mail.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce MediaWiki release mailing list]

Consult the [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents User's Guide] for information on using the wiki software.

<big>'''MediaWiki instalado com sucesso.'''</big>

Consulte o [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents Manual de Usuário] para informações de como usar o software wiki.

== Começando ==

* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:Configuration_settings Lista de opções de configuração]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:FAQ FAQ do MediaWiki]
* [https://lists.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce Lista de discussão com avisos de novas versões do MediaWiki]

Página principal

2016-11-17T18:04:15Z

Vsud:

''''''GRUPO DE MODELOS TEÓRICOS E COMPUTACIONAIS E LABORATÓRIO DE ESTRUTURAS CELULARES ''''''

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Instituto de Física - IF
Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS
PO Box 15051, 90501-970 Porto Alegre (RS), Brazil
Telephone: 55 (51) 3308-7251 - Fax: 55 (51) 3308-1762

O grupo trabalha com modelagem computacional em sistemas extensos físicos e biológicos tais como espumas, estruturas celulares e dinâmica de epidemias. Há também linhas ativas em dinâmica de informação em redes: redes metabólicas e sua evolução, redes de neurônios, redes sociais e econofísica.

=== Pesquisadores Efetivos ===

* Daniel Gamermann
* Gilberto de Lima Thomas
* [http://pcleon.if.ufrgs.br Leonardo Gregory Brunnet]
* Mendeli Vainstein
* [[Rita M. C. Almeida]]

=== Colaboradores ===

* [http://www.ufsm.br/pgfisica/professor/mombach.html José Carlos Merino Mombach (UFPampa/UFSM)]
* [http://www.if.ufrgs.br/~iglesias/JRIglesias_br.html José Roberto Iglesias (IF-UFRGS)]
* [http://www.if.ufrgs.br/cbrito/index.html Carolina Brito]
* [http://www.if.ufrgs.br/~arenzon Jeferson Arenzon]
* Raquel Giulian
* Rubem Erichsen Jr
* [http://www.if.ufrgs.br/~sgonc Sebastián Gonçalves]

=== Post-Docs ===
* Carine Beatrici

=== Estudantes Doutorado ===

* Beatriz Mizusaki
* Gabriel Perrone
* Ismael Fortuna
* Ricardo Melo Ferreira
* Samoel Renan Mello da Silva

=== Estudantes Mestrado ===
* Alessandra Friederich Lutz
* Eduarda Susin
* Juliano Gianlupi

=== Estudantes Iniciação Científica ===

* Aline Friederich Lütz
* Caroline Schmidt
* [[Cássio Kirch]]
* João Medeiros Dinis
* [[Paulo Casagrande Godolphim]]
* Pedro Inocêncio Rodrigues Terra
* Pricilla de Oliveira Henz
* Vítor Sudbrack

=== Laboratório de Estruturas Celulares ===

Dispõe de variados equipamentos destinados a experimentos de regeneração e
motilidade celular. Desde 2004
diferentes linhagens de culturas de Hidras: normais, verdes ou geneticamente modificadas para fluorescer.
Equipamentos: microscopia
de campo claro, de contraste de fase e de fluorescência integrados a
um sistema de aquisição de dados feito no IF, estufa de CO2 para
manutenção de cultura de células, centrífuga, autoclave, banho Maria
termostático, Phgâmetro, capela de fluxo laminar bem como um sistema
de computadores para controle e análise de experimentos

== Linhas de Pesquisa ==

* [[Segregação Celular]]
* [[Difusão e Armazenamento de Informação no Hipercubo: Redes Neurais e o Sistema Imunológico]]
* [[Difusão de Substâncias Químicas em Estruturas Celulares]]
* [[Dinâmica de Epidemias]]
* [[Laboratório de Estruturas Celulares]]
* [[Redes Aleatórias de Neurônios com Ruído]]
* [[Transição de vidro e propriedades de sólidos amorfos]]
* [[Espumas]]
* [[Estudo sobre as equações mestras para redes que crescem]]

== Intercâmbio Científico ==

* [http://cabfst28.cnea.gov.ar/~statisticalphysics/ Centro Atómico Bariloche - Argentina]
* [http://www.cea.fr/ Commissariat a l'Energie Atomique, Saclay, França]
* [http://www.iub.edu/ Indiana University - Bloomington, USA]
* [http://www.univ-paris-diderot.fr/english/ Université Paris Diderot - Paris 7, França]
* [http://www.ufrgs.br/biociencias/ Instituto de Biociências da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.cbiot.ufrgs.br/ Centro de Biotecnologia da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.inf.ufrgs.br/ Instituto de Informática da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.lps.u-psud.fr/ Laboratoire de Physique des Solides de Orsay, França]
* [http://www.uergs.edu.br/ UERGS]
* [http://www.uff.br/ UFF]
* [http://www.ufpe.br/ufpenova/ UFPE]
* [http://www.ufpr.br/portalufpr/ UFPR]
* [http://www.biologie.ens.fr/eceem/ Eco-Evolution Mathématique (IBENS, Paris) ]

==[[Seminários do Grupo MTC (FIP30150) - atualizado em 08/08/16]]==

'''Os seminários ocorrerão às 4as.-feiras, 12h30, em alguma sala do prédio O'''.
 
A ordem de apresentação segue abaixo.

{| class="wikitable"
|-
! scope="col" | Nome
! scope="col" | data
! scope="col" | título
|-
! scope="row"| Juliano
| 10/ago
|
|-
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| 17/ago
|
|-
! scope="row" | Caroline, Pedro Paulo e Guilherme
| 24/ago
| Apres. SIC
|-
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| 31/ago
| Apres. SIC
|-
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|
|-
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| 28/set
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|-
! scope="row"| Vinicius
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|
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|
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| 23/nov
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|-
! scope="row"| Vinicius
| 07/dez
|
|-
! scope="row"| Gilberto
| 14/dez
|
|-
! scope="row"| Leonardo
| 21/dez
|
|}

== [[Journal Club - Semetre 01/2016]] ==

* PDF do seminario apresentado por Daniel Gamermann dia 25/5/2016:
[http://lief.if.ufrgs.br/pub/seminars/mtc/jorn.pdf 42-O Universo a vida e tudo mais]
[http://lief.if.ufrgs.br/pub/seminars/mtc/Phanerozoic_Biodiversity.svg.png Diversidade da vida no eon Fanerozóico]

== [[ Workshop 2016 ]] ==

Sexta-feira:
8:30 - 9:00 -
9:00 - 9:30 - Prof. Mendelli
9:30 - 10:00 - Aline
10:00 - 10:30 - COFFEE BREAK
10:30 - 11:00 - Pricilla
11:00 - 11:30 - Gabriel
11:30 - 12:00 - Prof. Ricardo
12:00 - 13:30 - LUNCH BREAK
13:30 - 14:00 - Juliano
14:00 - 14:30 - Guilherme
14:30 - 15:00 - Vítor
15:00 -15:30 - Prof. Leonardo
15:30 -16:00 - COFFEE BREAK
16:00 - 16:30 - Samoel
16:30 - 17:00 - Cássio
17:00 - 17:30 - Prof. Gilberto

Sábado:
8:30 - 9:00 - COFFEE BREAK
9:00 - 9:30 - Prof. Rita
9:30 - 10:00 - João
10:00 - 10:30 - COFFEE BREAK
10:30 - 11:00 - Pedro
11:00 - 11:30 - Paulo
11:30 - 12:00 - Carol
12:00 - 12:30 - Prof. Daniel

== [[Reunioes ]] ==

== Softwares ==

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/viacomplex/ Via Complex]
* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/transcriptogramer/ Transcriptogramer]
== Curso Cuda ==

* [http://docs.nvidia.com/cuda/ Documentação disponível]

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/Cuda/ Curso IF-UFRGS - 2014/1]

== Getting started ==
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:Configuration_settings Configuration settings list]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:FAQ MediaWiki FAQ]
* [http://mail.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce MediaWiki release mailing list]

Consult the [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents User's Guide] for information on using the wiki software.

<big>'''MediaWiki instalado com sucesso.'''</big>

Consulte o [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents Manual de Usuário] para informações de como usar o software wiki.

== Começando ==

* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:Configuration_settings Lista de opções de configuração]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:FAQ FAQ do MediaWiki]
* [https://lists.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce Lista de discussão com avisos de novas versões do MediaWiki]

Estudo sobre as equações mestras para redes que crescem

2016-03-29T18:44:38Z

Vsud:

Redes (ou [https://en.wikipedia.org/wiki/Graph_theory grafos]) são instrumentos matemáticos usados para modelar problemas reais (biologia, telecomunicações, redes elétricas, economia, etc) e estudá-los sistematicamente. Particularmente, é possível estudar redes que crescem a partir de uma regra de adição de elementos bem definida. Estudamos numericamente o crescimento de algumas dessas redes, a partir de médias sobre simulações com sementes randômicas distinstas e, analiticamente, via [https://en.wikipedia.org/wiki/Master_equation equações mestras] que descrevem a rede em uma fase qualquer do crescimento através da probabilidade de ocorrência das diversas situações que o modelo comporta. A relevância deste trabalho se dá ao passo em que resolvendo estas equações também será possível prever o comportanto futuro dos sistemas reais a elas associados.

Journal Club

2016-03-29T18:41:12Z

Vsud: /* Março */

= 2016 =

== Abril ==
* 06/04/2016 Pricilla
* 13/04/2016 Aline
* 20/04/2016 Juliano
* 27/04/2016 Daniel

== Março ==
* 04/03/2016 Rita: paper Modified Furth equation describes both simulations and experiments.
* 09/03/2016 Vitor: Estudo sobre as equações mestras do crescimento de redes por duplicação e divergência.
* 16/03/2016 Cássio:
* 23/03/2016 Gilberto:
* 30/03/2016 Leo:

Estudo de redes

2016-03-29T18:39:55Z

Vsud: Limpou toda a página

Estudo sobre as equações mestras para redes que crescem

2016-03-29T18:37:00Z

Vsud: Criou página com 'Redes (ou grafos) são instrumentos matemáticos usados para modelar problemas reais (biologia, telecomunicações, redes elétricas, economia, etc) e estudá-los sistematica...'

Redes (ou grafos) são instrumentos matemáticos usados para modelar problemas reais (biologia, telecomunicações, redes elétricas, economia, etc) e estudá-los sistematicamente. Particularmente, é possível estudar redes que crescem a partir de uma regra de adição de elementos bem definida. Estudamos numericamente o crescimento de algumas dessas redes, a partir de médias sobre simulações com sementes randômicas distinstas e, analiticamente, via equações mestras que descrevem a rede em uma fase qualquer do crescimento através da probabilidade de ocorrência das diversas situações que o modelo comporta. A relevância deste trabalho se dá ao passo em que resolvendo estas equações também será possível prever o comportanto futuro dos sistemas reais a elas associados.

Página principal

2016-03-29T18:35:23Z

Vsud: /* Linhas de Pesquisa */

'''GRUPO DE MODELOS TEÓRICOS E COMPUTACIONAIS E LABORATÓRIO DE ESTRUTURAS CELULARES'''

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Instituto de Física - IF
Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS
PO Box 15051, 90501-970 Porto Alegre (RS), Brazil
Telephone: 55 (51) 3308-7251 - Fax: 55 (51) 3308-1762

O grupo trabalha com modelagem computacional em sistemas extensos físicos e biológicos tais como espumas, estruturas celulares e dinâmica de epidemias. Há também linhas ativas em dinâmica de informação em redes: redes metabólicas e sua evolução, redes de neurônios, redes sociais e econofísica.

=== Pesquisadores Efetivos ===

* Daniel Gamermann
* Gilberto de Lima Thomas
* [http://pcleon.if.ufrgs.br Leonardo Gregory Brunnet]
* [[Rita M. C. Almeida]]

=== Colaboradores ===

* [http://www.ufsm.br/pgfisica/professor/mombach.html José Carlos Merino Mombach (UFPampa/UFSM)]
* [http://www.if.ufrgs.br/~iglesias/JRIglesias_br.html José Roberto Iglesias (IF-UFRGS)]
* [http://www.if.ufrgs.br/cbrito/index.html Carolina Brito]
* [http://www.if.ufrgs.br/~arenzon Jeferson Arenzon]
* Rubem Erichsen Jr
* [http://www.if.ufrgs.br/~sgonc Sebastián Gonçalves]

=== Post-Docs ===

=== Estudantes Doutorado ===

* Beatriz Mizusaki
* Gabriel Perrone
* Ismael Fortuna
* Ricardo Melo Ferreira

=== Estudantes Mestrado ===
* Alessandra Friederich Lutz
* Eduarda Susin
* Juliano Gianlupi

=== Estudantes Iniciação Científica ===

* Aline Friederich Lütz
* Cássio Kirch
* João Medeiros Dinis
* Paulo Casagrande Godolphim
* Pedro Inocêncio Rodrigues Terra
* Pricilla de Oliveira Henz
* Vítor Sudbrack

=== Laboratório de Estruturas Celulares ===

Dispõe de variados equipamentos destinados a experimentos de regeneração e
motilidade celular. Desde 2004
diferentes linhagens de culturas de Hidras: normais, verdes ou geneticamente modificadas para fluorescer.
Equipamentos: microscopia
de campo claro, de contraste de fase e de fluorescência integrados a
um sistema de aquisição de dados feito no IF, estufa de CO2 para
manutenção de cultura de células, centrífuga, autoclave, banho Maria
termostático, Phgâmetro, capela de fluxo laminar bem como um sistema
de computadores para controle e análise de experimentos

== Linhas de Pesquisa ==

* [[Segregação Celular]]
* [[Difusão e Armazenamento de Informação no Hipercubo: Redes Neurais e o Sistema Imunológico]]
* [[Difusão de Substâncias Químicas em Estruturas Celulares]]
* [[Dinâmica de Epidemias]]
* [[Laboratório de Estruturas Celulares]]
* [[Redes Aleatórias de Neurônios com Ruído]]
* [[Transição de vidro e propriedades de sólidos amorfos]]
* [[Espumas]]
* [[Estudo sobre as equações mestras para redes que crescem]]

== Intercâmbio Científico ==

* [http://cabfst28.cnea.gov.ar/~statisticalphysics/ Centro Atómico Bariloche - Argentina]
* [http://www.cea.fr/ Commissariat a l'Energie Atomique, Saclay, França]
* [http://www.iub.edu/ Indiana University - Bloomington, USA]
* [http://www.univ-paris-diderot.fr/english/ Université Paris Diderot - Paris 7, França]
* [http://www.ufrgs.br/biociencias/ Instituto de Biociências da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.cbiot.ufrgs.br/ Centro de Biotecnologia da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.inf.ufrgs.br/ Instituto de Informática da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.lps.u-psud.fr/ Laboratoire de Physique des Solides de Orsay, França]
* [http://www.uergs.edu.br/ UERGS]
* [http://www.uff.br/ UFF]
* [http://www.ufpe.br/ufpenova/ UFPE]
* [http://www.ufpr.br/portalufpr/ UFPR]
* [http://www.biologie.ens.fr/eceem/ Eco-Evolution Mathématique (IBENS, Paris) ]

== [[Journal Club]] ==

== Softwares ==

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/viacomplex/ Via Complex]
* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/transcriptogramer/ Transcriptogramer]
== Curso Cuda ==

* [http://docs.nvidia.com/cuda/ Documentação disponível]

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/Cuda/ Curso IF-UFRGS - 2014/1]

== Getting started ==
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:Configuration_settings Configuration settings list]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:FAQ MediaWiki FAQ]
* [http://mail.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce MediaWiki release mailing list]

Consult the [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents User's Guide] for information on using the wiki software.

<big>'''MediaWiki instalado com sucesso.'''</big>

Consulte o [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents Manual de Usuário] para informações de como usar o software wiki.

== Começando ==

* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:Configuration_settings Lista de opções de configuração]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:FAQ FAQ do MediaWiki]
* [https://lists.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce Lista de discussão com avisos de novas versões do MediaWiki]

Estudo de redes

2016-03-29T18:31:49Z

Redes (ou grafos) são instrumentos matemáticos usados para modelar problemas reais (biologia, telecomunicações, redes elétricas, economia, etc) e estudá-los sistematicamente. Particularmente, é possível estudar redes que cresçam a partir de uma regra de adição de elementos bem definida. Estudamos numericamente o crescimento de algumas dessas redes, a partir de médias sobre simulações com sementes randômicas distinstas e, analiticamente, via equações mestras que descrevem a rede em uma fase qualquer do crescimento através da probabilidade de ocorrência das diversas situações que o modelo comporta.
A relevância deste trabalho se dá ao passo em que resolver estas equações será também possível prever o comportanto futuro dos sistemas reais a elas associados.

Página principal

2016-03-29T18:27:54Z

Vsud: /* Linhas de Pesquisa */

'''GRUPO DE MODELOS TEÓRICOS E COMPUTACIONAIS E LABORATÓRIO DE ESTRUTURAS CELULARES'''

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Instituto de Física - IF
Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS
PO Box 15051, 90501-970 Porto Alegre (RS), Brazil
Telephone: 55 (51) 3308-7251 - Fax: 55 (51) 3308-1762

O grupo trabalha com modelagem computacional em sistemas extensos físicos e biológicos tais como espumas, estruturas celulares e dinâmica de epidemias. Há também linhas ativas em dinâmica de informação em redes: redes metabólicas e sua evolução, redes de neurônios, redes sociais e econofísica.

=== Pesquisadores Efetivos ===

* Daniel Gamermann
* Gilberto de Lima Thomas
* [http://pcleon.if.ufrgs.br Leonardo Gregory Brunnet]
* [[Rita M. C. Almeida]]

=== Colaboradores ===

* [http://www.ufsm.br/pgfisica/professor/mombach.html José Carlos Merino Mombach (UFPampa/UFSM)]
* [http://www.if.ufrgs.br/~iglesias/JRIglesias_br.html José Roberto Iglesias (IF-UFRGS)]
* [http://www.if.ufrgs.br/cbrito/index.html Carolina Brito]
* [http://www.if.ufrgs.br/~arenzon Jeferson Arenzon]
* Rubem Erichsen Jr
* [http://www.if.ufrgs.br/~sgonc Sebastián Gonçalves]

=== Post-Docs ===

=== Estudantes Doutorado ===

* Beatriz Mizusaki
* Gabriel Perrone
* Ismael Fortuna
* Ricardo Melo Ferreira

=== Estudantes Mestrado ===
* Alessandra Friederich Lutz
* Eduarda Susin
* Juliano Gianlupi

=== Estudantes Iniciação Científica ===

* Aline Friederich Lütz
* Cássio Kirch
* João Medeiros Dinis
* Paulo Casagrande Godolphim
* Pedro Inocêncio Rodrigues Terra
* Pricilla de Oliveira Henz
* Vítor Sudbrack

=== Laboratório de Estruturas Celulares ===

Dispõe de variados equipamentos destinados a experimentos de regeneração e
motilidade celular. Desde 2004
diferentes linhagens de culturas de Hidras: normais, verdes ou geneticamente modificadas para fluorescer.
Equipamentos: microscopia
de campo claro, de contraste de fase e de fluorescência integrados a
um sistema de aquisição de dados feito no IF, estufa de CO2 para
manutenção de cultura de células, centrífuga, autoclave, banho Maria
termostático, Phgâmetro, capela de fluxo laminar bem como um sistema
de computadores para controle e análise de experimentos

== Linhas de Pesquisa ==

* [[Segregação Celular]]
* [[Difusão e Armazenamento de Informação no Hipercubo: Redes Neurais e o Sistema Imunológico]]
* [[Difusão de Substâncias Químicas em Estruturas Celulares]]
* [[Dinâmica de Epidemias]]
* [[Laboratório de Estruturas Celulares]]
* [[Redes Aleatórias de Neurônios com Ruído]]
* [[Transição de vidro e propriedades de sólidos amorfos]]
* [[Espumas]]
* [[Estudo de redes]]

== Intercâmbio Científico ==

* [http://cabfst28.cnea.gov.ar/~statisticalphysics/ Centro Atómico Bariloche - Argentina]
* [http://www.cea.fr/ Commissariat a l'Energie Atomique, Saclay, França]
* [http://www.iub.edu/ Indiana University - Bloomington, USA]
* [http://www.univ-paris-diderot.fr/english/ Université Paris Diderot - Paris 7, França]
* [http://www.ufrgs.br/biociencias/ Instituto de Biociências da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.cbiot.ufrgs.br/ Centro de Biotecnologia da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.inf.ufrgs.br/ Instituto de Informática da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.lps.u-psud.fr/ Laboratoire de Physique des Solides de Orsay, França]
* [http://www.uergs.edu.br/ UERGS]
* [http://www.uff.br/ UFF]
* [http://www.ufpe.br/ufpenova/ UFPE]
* [http://www.ufpr.br/portalufpr/ UFPR]
* [http://www.biologie.ens.fr/eceem/ Eco-Evolution Mathématique (IBENS, Paris) ]

== [[Journal Club]] ==

== Softwares ==

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/viacomplex/ Via Complex]
* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/transcriptogramer/ Transcriptogramer]
== Curso Cuda ==

* [http://docs.nvidia.com/cuda/ Documentação disponível]

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/Cuda/ Curso IF-UFRGS - 2014/1]

== Getting started ==
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:Configuration_settings Configuration settings list]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:FAQ MediaWiki FAQ]
* [http://mail.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce MediaWiki release mailing list]

Consult the [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents User's Guide] for information on using the wiki software.

<big>'''MediaWiki instalado com sucesso.'''</big>

Consulte o [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents Manual de Usuário] para informações de como usar o software wiki.

== Começando ==

* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:Configuration_settings Lista de opções de configuração]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:FAQ FAQ do MediaWiki]
* [https://lists.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce Lista de discussão com avisos de novas versões do MediaWiki]