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Segregação Celular

2024-02-27T13:13:32Z

Leon: /* Modelagem de segregação celular: animóides */

== ''' Modelagem de segregação celular: animóides''' ==

A partir da caracterização experimental da difusão celular como o mecanismo responsável pela segrega
ção por Holtfreter em 1944 (Holtfreter1944) iniciou-se a discussão sobre a natureza desta difusão. E
ntre as várias hipóteses levantadas, a “Hipótese da Adesão Diferenciada” (HAD), proposta em 1962 por
M. S. Steinberg (Steinber1962), é a mais aceita atualmente. Segundo ela, dois ingredientes básicos regulam a segregação: motilidade e diferentes graus de adesão. Ao se difundirem devido à motilidade, a
s células mais adesivas acabam formando um agregado central, com as células do tecido menos adesivo
ficando no entorno.

A simplicidade da hipótese é tentadora e levou à busca da origem da motilidade e das diferenças nas
adesividades. Experimentos recentes confirmam alguns dos postulados da HAD: medidas de tensão superfici al
em tecidos de embrião de aves (Foty1994) e a determinação da intensidade das forças de adesão entre
pares de células de ''Hydra'' (Sato1994) confirmam as magnitudes das forças necessárias para o envolvimento
dos tecidos. Além disso, várias caracterizações experimentais relacionadas com a difusão
celular foram feitas: movimento celular induzido por flutuação da membrana celular (Mombach1995), movimento
coerente de grupos de células (Rieu1998) e tempos característicos de aprisionamento diferenciados
por tecido(Rieu2000).

Esses resultados permitem-nos projetar modelagens computacionais quantitativas ou, pelo menos, semi-quantitativas.
Neste contexto, Graner e Glazier(Graner1992) introduziram as primeiras simulações usando o
modelo GGH(Glazier2006) e mostraram que a segregação pode ocorrer com as células mais adesivas sendo
envolvidas pelas menos adesivas. No entanto, esta abordagem, além de ter sido feita apenas em duas dime
nsões, não leva em consideração os movimentos coerentes de grupos de células constatados experimentalmente,
ou seja, não considera interações dependentes de velocidade.

Nessa linha investigamos a dinâmica de segregação de células gerada a partir da competição entre os diversos mecanismos
constatados experimentalmente: adesão diferencial, difusão browniana e movimentos coerentes de grupos de células. As questões
aí formuladas são as seguintes: Existe universalidade associada ao processo de crescimento e segregação? Para que
conjunto de parâmetros? Há alguma escala de tempo/tamanho onde um ou outro dos mecanismos domina?

A resposta a essas perguntas passa pela construção de ferramentas de simulação e análise. De fato, todos os mecanismos
detectados experimentalmente podem ser incluídos em modelos de partículas auto-propelentes - animóides - que se tornaram
conhecidos não apenas na descrição de movimentos de grupos de animais(Vicsek1995), mas também na dinâmica de banhos de
bactérias(Wu2000,Sokolov2007), em colônias de amebas e bactérias (Benjacob1995, Rieu2005), ou ainda em grupos de células
movendo-se em um substrato, como melanócitos (Gruler1999).

Nossos trabalhos iniciam com a construção ''ab initio'' de programas, em colaboração com H. Chaté do CEA-Saclay, visand
o o estudo em duas dimensões de segregação celular em células de hidra e na construção do diagrama de fases do sistema
com dois tipos distintos de animóides (Belmonte2007, Belmonte2008). Estamos buscando as relações entre parâmetros que p
ropiciem a segregação, as escalas espaço-temporais onde ela ocorre e a existência, ou não, de universalidade no fenôme
no. A mesma busca será feita em três dimensões quando a comparação com experimentos torna-se possível. Na parte experi
mental contamos com a colaboração de J. P. Rieu da Université Claude Bernard de Lyon.

As perguntas a serem respondida são

# Como termos de interação dependentes de velocidade influenciam a segregação?
# Como se dá a evolução espaço-temporal da segregação?
# Como os resultados das simulações comparam-se com os dados experimentais?

Pesquisadores: Leonardo G. Brunnet, Gilberto Lima Thomas e Rita M.C. de Almeida

Estudantes: Carine Beatrici, Aline Lütz, Cássio Kirch

Colaboradores externos: Jean Paul Rieu, Hugues Chaté

[[File:00719.jpg|Hidra Segregando]]

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2023-01-29T12:03:39Z

Leon: /* Gravações de Apresentações */

''''''GRUPO DE MODELOS TEÓRICOS E COMPUTACIONAIS E LABORATÓRIO DE ESTRUTURAS CELULARES ''''''

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Instituto de Física - IF
Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS
PO Box 15051, 90501-970 Porto Alegre (RS), Brazil
Telephone: 55 (51) 3308-7251 - Fax: 55 (51) 3308-1762

O grupo trabalha com modelagem computacional em sistemas extensos físicos e biológicos tais como espumas, estruturas celulares e dinâmica de epidemias. Há também linhas ativas em dinâmica de informação em redes: redes metabólicas e sua evolução, redes de neurônios, redes sociais e econofísica.

=== Pesquisadores Efetivos ===

* Daniel Gamermann
* Gilberto de Lima Thomas
* [http://pcleon.if.ufrgs.br Leonardo Gregory Brunnet]
* Mendeli Vainstein
* [[Rita M. C. Almeida]]

=== Colaboradores ===

* [http://www.ufsm.br/pgfisica/professor/mombach.html José Carlos Merino Mombach (UFPampa/UFSM)]
* [http://www.if.ufrgs.br/~iglesias/JRIglesias_br.html José Roberto Iglesias (IF-UFRGS)]
* [http://www.if.ufrgs.br/cbrito/index.html Carolina Brito]
* [http://www.if.ufrgs.br/~arenzon Jeferson Arenzon]
* Raquel Giulian
* Rubem Erichsen Jr
* [http://www.if.ufrgs.br/~sgonc Sebastián Gonçalves]

=== Post-Docs ===
* Carine Beatrici

=== Estudantes Doutorado ===

* Emanuel Fortes
* Gabriel Perrone
*[[Paulo Casagrande Godolphim]]
* Gustavo Ourique
* Guilherme Shoiti Yoshimatsu Giardini

=== Estudantes Mestrado ===
* Bernardo Boatini

=== Estudantes Iniciação Científica ===
* [[Cássio Kirch]]

=== Laboratório de Estruturas Celulares ===

Dispõe de variados equipamentos destinados a experimentos de regeneração e
motilidade celular. Desde 2004
diferentes linhagens de culturas de Hidras: normais, verdes ou geneticamente modificadas para fluorescer.
Equipamentos: microscopia
de campo claro, de contraste de fase e de fluorescência integrados a
um sistema de aquisição de dados feito no IF, estufa de CO2 para
manutenção de cultura de células, centrífuga, autoclave, banho Maria
termostático, Phgâmetro, capela de fluxo laminar bem como um sistema
de computadores para controle e análise de experimentos

== Linhas de Pesquisa ==

* [[Segregação Celular]]
* [[Difusão e Armazenamento de Informação no Hipercubo: Redes Neurais e o Sistema Imunológico]]
* [[Difusão de Substâncias Químicas em Estruturas Celulares]]
* [[Dinâmica de Epidemias]]
* [[Laboratório de Estruturas Celulares]]
* [[Redes Aleatórias de Neurônios com Ruído]]
* [[Transição de vidro e propriedades de sólidos amorfos]]
* [[Espumas]]
* [[Estudo sobre as equações mestras para redes que crescem]]

== Intercâmbio Científico ==

* [http://cabfst28.cnea.gov.ar/~statisticalphysics/ Centro Atómico Bariloche - Argentina]
* [http://www.cea.fr/ Commissariat a l'Energie Atomique, Saclay, França]
* [http://www.iub.edu/ Indiana University - Bloomington, USA]
* [http://www.univ-paris-diderot.fr/english/ Université Paris Diderot - Paris 7, França]
* [http://www.ufrgs.br/biociencias/ Instituto de Biociências da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.cbiot.ufrgs.br/ Centro de Biotecnologia da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.inf.ufrgs.br/ Instituto de Informática da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.lps.u-psud.fr/ Laboratoire de Physique des Solides de Orsay, França]
* [http://www.uergs.edu.br/ UERGS]
* [http://www.uff.br/ UFF]
* [http://www.ufpe.br/ufpenova/ UFPE]
* [http://www.ufpr.br/portalufpr/ UFPR]
* [http://www.biologie.ens.fr/eceem/ Eco-Evolution Mathématique (IBENS, Paris) ]

==Seminários do Grupo MTC - atualizado em 2/12/22==

'''Os seminários ocorrerão às 2as.-feiras, 14h00, na sala do prédio O207'''.
 

== Journal Club - Semetre 01/2016 ==

* PDF do seminario apresentado por Daniel Gamermann dia 25/5/2016:
[http://lief.if.ufrgs.br/pub/seminars/mtc/jorn.pdf 42-O Universo a vida e tudo mais]
[http://lief.if.ufrgs.br/pub/seminars/mtc/Phanerozoic_Biodiversity.svg.png Diversidade da vida no eon Fanerozóico]

== Vídeos de Apresentações do Grupo==
* [http://pcleon.if.ufrgs.br/pub/mtc/TCC_Bernardo_ed_221130.mp4 TCC-Bernardo-30/11/2022]
* [http://pcleon.if.ufrgs.br/pub/mtc/Pedro-Castel_230127.mp4 Pedro-Castel-Apresentação-Grupo-27/01/2023]

== Softwares ==

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/viacomplex/ Via Complex]
* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/transcriptogramer/ Transcriptogramer]
== Curso Cuda ==

* [http://docs.nvidia.com/cuda/ Documentação disponível]

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/Cuda/ Curso IF-UFRGS - 2014/1]

== Getting started ==
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:Configuration_settings Configuration settings list]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:FAQ MediaWiki FAQ]
* [http://mail.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce MediaWiki release mailing list]

Consult the [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents User's Guide] for information on using the wiki software.

<big>'''MediaWiki instalado com sucesso.'''</big>

Consulte o [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents Manual de Usuário] para informações de como usar o software wiki.

== Começando ==

* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:Configuration_settings Lista de opções de configuração]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:FAQ FAQ do MediaWiki]
* [https://lists.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce Lista de discussão com avisos de novas versões do MediaWiki]

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Leon: /* Gravações de Apresentações */

''''''GRUPO DE MODELOS TEÓRICOS E COMPUTACIONAIS E LABORATÓRIO DE ESTRUTURAS CELULARES ''''''

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Instituto de Física - IF
Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS
PO Box 15051, 90501-970 Porto Alegre (RS), Brazil
Telephone: 55 (51) 3308-7251 - Fax: 55 (51) 3308-1762

O grupo trabalha com modelagem computacional em sistemas extensos físicos e biológicos tais como espumas, estruturas celulares e dinâmica de epidemias. Há também linhas ativas em dinâmica de informação em redes: redes metabólicas e sua evolução, redes de neurônios, redes sociais e econofísica.

=== Pesquisadores Efetivos ===

* Daniel Gamermann
* Gilberto de Lima Thomas
* [http://pcleon.if.ufrgs.br Leonardo Gregory Brunnet]
* Mendeli Vainstein
* [[Rita M. C. Almeida]]

=== Colaboradores ===

* [http://www.ufsm.br/pgfisica/professor/mombach.html José Carlos Merino Mombach (UFPampa/UFSM)]
* [http://www.if.ufrgs.br/~iglesias/JRIglesias_br.html José Roberto Iglesias (IF-UFRGS)]
* [http://www.if.ufrgs.br/cbrito/index.html Carolina Brito]
* [http://www.if.ufrgs.br/~arenzon Jeferson Arenzon]
* Raquel Giulian
* Rubem Erichsen Jr
* [http://www.if.ufrgs.br/~sgonc Sebastián Gonçalves]

=== Post-Docs ===
* Carine Beatrici

=== Estudantes Doutorado ===

* Emanuel Fortes
* Gabriel Perrone
*[[Paulo Casagrande Godolphim]]
* Gustavo Ourique
* Guilherme Shoiti Yoshimatsu Giardini

=== Estudantes Mestrado ===
* Bernardo Boatini

=== Estudantes Iniciação Científica ===
* [[Cássio Kirch]]

=== Laboratório de Estruturas Celulares ===

Dispõe de variados equipamentos destinados a experimentos de regeneração e
motilidade celular. Desde 2004
diferentes linhagens de culturas de Hidras: normais, verdes ou geneticamente modificadas para fluorescer.
Equipamentos: microscopia
de campo claro, de contraste de fase e de fluorescência integrados a
um sistema de aquisição de dados feito no IF, estufa de CO2 para
manutenção de cultura de células, centrífuga, autoclave, banho Maria
termostático, Phgâmetro, capela de fluxo laminar bem como um sistema
de computadores para controle e análise de experimentos

== Linhas de Pesquisa ==

* [[Segregação Celular]]
* [[Difusão e Armazenamento de Informação no Hipercubo: Redes Neurais e o Sistema Imunológico]]
* [[Difusão de Substâncias Químicas em Estruturas Celulares]]
* [[Dinâmica de Epidemias]]
* [[Laboratório de Estruturas Celulares]]
* [[Redes Aleatórias de Neurônios com Ruído]]
* [[Transição de vidro e propriedades de sólidos amorfos]]
* [[Espumas]]
* [[Estudo sobre as equações mestras para redes que crescem]]

== Intercâmbio Científico ==

* [http://cabfst28.cnea.gov.ar/~statisticalphysics/ Centro Atómico Bariloche - Argentina]
* [http://www.cea.fr/ Commissariat a l'Energie Atomique, Saclay, França]
* [http://www.iub.edu/ Indiana University - Bloomington, USA]
* [http://www.univ-paris-diderot.fr/english/ Université Paris Diderot - Paris 7, França]
* [http://www.ufrgs.br/biociencias/ Instituto de Biociências da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.cbiot.ufrgs.br/ Centro de Biotecnologia da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.inf.ufrgs.br/ Instituto de Informática da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.lps.u-psud.fr/ Laboratoire de Physique des Solides de Orsay, França]
* [http://www.uergs.edu.br/ UERGS]
* [http://www.uff.br/ UFF]
* [http://www.ufpe.br/ufpenova/ UFPE]
* [http://www.ufpr.br/portalufpr/ UFPR]
* [http://www.biologie.ens.fr/eceem/ Eco-Evolution Mathématique (IBENS, Paris) ]

==Seminários do Grupo MTC - atualizado em 2/12/22==

'''Os seminários ocorrerão às 2as.-feiras, 14h00, na sala do prédio O207'''.
 

== Journal Club - Semetre 01/2016 ==

* PDF do seminario apresentado por Daniel Gamermann dia 25/5/2016:
[http://lief.if.ufrgs.br/pub/seminars/mtc/jorn.pdf 42-O Universo a vida e tudo mais]
[http://lief.if.ufrgs.br/pub/seminars/mtc/Phanerozoic_Biodiversity.svg.png Diversidade da vida no eon Fanerozóico]

== Gravações de Apresentações==
* [http://pcleon.if.ufrgs.br/pub/mtc/TCC_Bernardo_ed_221130.mp4 TCC-Bernardo-30/11/2022]
* [http://pcleon.if.ufrgs.br/pub/mtc/Pedro-Castel_230127.mp4 Pedro-Castel-Apresentação-Grupo-27/01/2023]

== Softwares ==

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/viacomplex/ Via Complex]
* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/transcriptogramer/ Transcriptogramer]
== Curso Cuda ==

* [http://docs.nvidia.com/cuda/ Documentação disponível]

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/Cuda/ Curso IF-UFRGS - 2014/1]

== Getting started ==
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:Configuration_settings Configuration settings list]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:FAQ MediaWiki FAQ]
* [http://mail.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce MediaWiki release mailing list]

Consult the [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents User's Guide] for information on using the wiki software.

<big>'''MediaWiki instalado com sucesso.'''</big>

Consulte o [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents Manual de Usuário] para informações de como usar o software wiki.

== Começando ==

* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:Configuration_settings Lista de opções de configuração]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:FAQ FAQ do MediaWiki]
* [https://lists.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce Lista de discussão com avisos de novas versões do MediaWiki]

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2022-12-05T21:32:06Z

Leon: /* Gravações de Apresentações */

''''''GRUPO DE MODELOS TEÓRICOS E COMPUTACIONAIS E LABORATÓRIO DE ESTRUTURAS CELULARES ''''''

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Instituto de Física - IF
Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS
PO Box 15051, 90501-970 Porto Alegre (RS), Brazil
Telephone: 55 (51) 3308-7251 - Fax: 55 (51) 3308-1762

O grupo trabalha com modelagem computacional em sistemas extensos físicos e biológicos tais como espumas, estruturas celulares e dinâmica de epidemias. Há também linhas ativas em dinâmica de informação em redes: redes metabólicas e sua evolução, redes de neurônios, redes sociais e econofísica.

=== Pesquisadores Efetivos ===

* Daniel Gamermann
* Gilberto de Lima Thomas
* [http://pcleon.if.ufrgs.br Leonardo Gregory Brunnet]
* Mendeli Vainstein
* [[Rita M. C. Almeida]]

=== Colaboradores ===

* [http://www.ufsm.br/pgfisica/professor/mombach.html José Carlos Merino Mombach (UFPampa/UFSM)]
* [http://www.if.ufrgs.br/~iglesias/JRIglesias_br.html José Roberto Iglesias (IF-UFRGS)]
* [http://www.if.ufrgs.br/cbrito/index.html Carolina Brito]
* [http://www.if.ufrgs.br/~arenzon Jeferson Arenzon]
* Raquel Giulian
* Rubem Erichsen Jr
* [http://www.if.ufrgs.br/~sgonc Sebastián Gonçalves]

=== Post-Docs ===
* Carine Beatrici

=== Estudantes Doutorado ===

* Emanuel Fortes
* Gabriel Perrone
*[[Paulo Casagrande Godolphim]]
* Gustavo Ourique
* Guilherme Shoiti Yoshimatsu Giardini

=== Estudantes Mestrado ===
* Bernardo Boatini

=== Estudantes Iniciação Científica ===
* [[Cássio Kirch]]

=== Laboratório de Estruturas Celulares ===

Dispõe de variados equipamentos destinados a experimentos de regeneração e
motilidade celular. Desde 2004
diferentes linhagens de culturas de Hidras: normais, verdes ou geneticamente modificadas para fluorescer.
Equipamentos: microscopia
de campo claro, de contraste de fase e de fluorescência integrados a
um sistema de aquisição de dados feito no IF, estufa de CO2 para
manutenção de cultura de células, centrífuga, autoclave, banho Maria
termostático, Phgâmetro, capela de fluxo laminar bem como um sistema
de computadores para controle e análise de experimentos

== Linhas de Pesquisa ==

* [[Segregação Celular]]
* [[Difusão e Armazenamento de Informação no Hipercubo: Redes Neurais e o Sistema Imunológico]]
* [[Difusão de Substâncias Químicas em Estruturas Celulares]]
* [[Dinâmica de Epidemias]]
* [[Laboratório de Estruturas Celulares]]
* [[Redes Aleatórias de Neurônios com Ruído]]
* [[Transição de vidro e propriedades de sólidos amorfos]]
* [[Espumas]]
* [[Estudo sobre as equações mestras para redes que crescem]]

== Intercâmbio Científico ==

* [http://cabfst28.cnea.gov.ar/~statisticalphysics/ Centro Atómico Bariloche - Argentina]
* [http://www.cea.fr/ Commissariat a l'Energie Atomique, Saclay, França]
* [http://www.iub.edu/ Indiana University - Bloomington, USA]
* [http://www.univ-paris-diderot.fr/english/ Université Paris Diderot - Paris 7, França]
* [http://www.ufrgs.br/biociencias/ Instituto de Biociências da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.cbiot.ufrgs.br/ Centro de Biotecnologia da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.inf.ufrgs.br/ Instituto de Informática da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.lps.u-psud.fr/ Laboratoire de Physique des Solides de Orsay, França]
* [http://www.uergs.edu.br/ UERGS]
* [http://www.uff.br/ UFF]
* [http://www.ufpe.br/ufpenova/ UFPE]
* [http://www.ufpr.br/portalufpr/ UFPR]
* [http://www.biologie.ens.fr/eceem/ Eco-Evolution Mathématique (IBENS, Paris) ]

==Seminários do Grupo MTC - atualizado em 2/12/22==

'''Os seminários ocorrerão às 2as.-feiras, 14h00, na sala do prédio O207'''.
 

== Journal Club - Semetre 01/2016 ==

* PDF do seminario apresentado por Daniel Gamermann dia 25/5/2016:
[http://lief.if.ufrgs.br/pub/seminars/mtc/jorn.pdf 42-O Universo a vida e tudo mais]
[http://lief.if.ufrgs.br/pub/seminars/mtc/Phanerozoic_Biodiversity.svg.png Diversidade da vida no eon Fanerozóico]

== Gravações de Apresentações==
* [http://pcleon.if.ufrgs.br/pub/mtc/TCC_Bernardo_ed_221130.mp4 TCC-Bernardo-30/11/2022]

== Softwares ==

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/viacomplex/ Via Complex]
* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/transcriptogramer/ Transcriptogramer]
== Curso Cuda ==

* [http://docs.nvidia.com/cuda/ Documentação disponível]

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/Cuda/ Curso IF-UFRGS - 2014/1]

== Getting started ==
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:Configuration_settings Configuration settings list]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:FAQ MediaWiki FAQ]
* [http://mail.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce MediaWiki release mailing list]

Consult the [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents User's Guide] for information on using the wiki software.

<big>'''MediaWiki instalado com sucesso.'''</big>

Consulte o [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents Manual de Usuário] para informações de como usar o software wiki.

== Começando ==

* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:Configuration_settings Lista de opções de configuração]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:FAQ FAQ do MediaWiki]
* [https://lists.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce Lista de discussão com avisos de novas versões do MediaWiki]

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2022-12-05T21:31:47Z

Leon: /* Apresentações */

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2022-12-05T21:29:41Z

Leon: /* Apresentações */

Apresentações

2022-12-05T21:27:57Z

Leon: Criou página com '[http://pcleon.if.ufrgs.br/pub/mtc/TCC_Bernardo_ed_221130.mp4 TCC - Bernardo - 30/11/2022]'

[http://pcleon.if.ufrgs.br/pub/mtc/TCC_Bernardo_ed_221130.mp4 TCC - Bernardo - 30/11/2022]

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2022-12-05T17:57:07Z

Leon: /* Estudantes Iniciação Científica */

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2022-12-02T22:07:56Z

Leon: /* Reunioes */

2016-07-06T16:14:46Z

Leon:

- 04/06 -

Cassio - Debugando o programa, problema do sinal da forca

Vitor - Rodando para tempos longos, descobriu o NaN que limitava a expansao

Juliano - Rodando as simulacoes do cilindro com duas bolhas.

Joao - Terminando bem o semestre.

Paulo - Mostrou o algoritmo do rotacional.

Mendeli - Tentando fazer o filme e programando o proximo experimento.

- 06/07 -

Journal Club - Vitor Sudbrack - Redes, Vulnerabilidade e Teoria de Percolacao

Presentes:

Aline,
Daniel,
Guilherme,
Leonardo,
Mendeli,
Paulo,
Vitor

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2016-07-06T16:13:09Z

Leon: /* Reunioes */

Reunioes

2016-07-06T16:11:22Z

Leon: /* 04/06 */

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2016-07-06T16:09:00Z

Leon: /* Reunioes */

''''''GRUPO DE MODELOS TEÓRICOS E COMPUTACIONAIS E LABORATÓRIO DE ESTRUTURAS CELULARES''''''

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Instituto de Física - IF
Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS
PO Box 15051, 90501-970 Porto Alegre (RS), Brazil
Telephone: 55 (51) 3308-7251 - Fax: 55 (51) 3308-1762

O grupo trabalha com modelagem computacional em sistemas extensos físicos e biológicos tais como espumas, estruturas celulares e dinâmica de epidemias. Há também linhas ativas em dinâmica de informação em redes: redes metabólicas e sua evolução, redes de neurônios, redes sociais e econofísica.

=== Pesquisadores Efetivos ===

* Daniel Gamermann
* Gilberto de Lima Thomas
* [http://pcleon.if.ufrgs.br Leonardo Gregory Brunnet]
* Mendeli Vainstein
* [[Rita M. C. Almeida]]

=== Colaboradores ===

* [http://www.ufsm.br/pgfisica/professor/mombach.html José Carlos Merino Mombach (UFPampa/UFSM)]
* [http://www.if.ufrgs.br/~iglesias/JRIglesias_br.html José Roberto Iglesias (IF-UFRGS)]
* [http://www.if.ufrgs.br/cbrito/index.html Carolina Brito]
* [http://www.if.ufrgs.br/~arenzon Jeferson Arenzon]
* Raquel Giulian
* Rubem Erichsen Jr
* [http://www.if.ufrgs.br/~sgonc Sebastián Gonçalves]

=== Post-Docs ===
* Carine Beatrici

=== Estudantes Doutorado ===

* Beatriz Mizusaki
* Gabriel Perrone
* Ismael Fortuna
* Ricardo Melo Ferreira
* Samoel Renan Mello da Silva

=== Estudantes Mestrado ===
* Alessandra Friederich Lutz
* Eduarda Susin
* Juliano Gianlupi

=== Estudantes Iniciação Científica ===

* Aline Friederich Lütz
* Caroline Schmidt
* Cássio Kirch
* João Medeiros Dinis
* Paulo Casagrande Godolphim
* Pedro Inocêncio Rodrigues Terra
* Pricilla de Oliveira Henz
* Vítor Sudbrack

=== Laboratório de Estruturas Celulares ===

Dispõe de variados equipamentos destinados a experimentos de regeneração e
motilidade celular. Desde 2004
diferentes linhagens de culturas de Hidras: normais, verdes ou geneticamente modificadas para fluorescer.
Equipamentos: microscopia
de campo claro, de contraste de fase e de fluorescência integrados a
um sistema de aquisição de dados feito no IF, estufa de CO2 para
manutenção de cultura de células, centrífuga, autoclave, banho Maria
termostático, Phgâmetro, capela de fluxo laminar bem como um sistema
de computadores para controle e análise de experimentos

== Linhas de Pesquisa ==

* [[Segregação Celular]]
* [[Difusão e Armazenamento de Informação no Hipercubo: Redes Neurais e o Sistema Imunológico]]
* [[Difusão de Substâncias Químicas em Estruturas Celulares]]
* [[Dinâmica de Epidemias]]
* [[Laboratório de Estruturas Celulares]]
* [[Redes Aleatórias de Neurônios com Ruído]]
* [[Transição de vidro e propriedades de sólidos amorfos]]
* [[Espumas]]
* [[Estudo sobre as equações mestras para redes que crescem]]

== Intercâmbio Científico ==

* [http://cabfst28.cnea.gov.ar/~statisticalphysics/ Centro Atómico Bariloche - Argentina]
* [http://www.cea.fr/ Commissariat a l'Energie Atomique, Saclay, França]
* [http://www.iub.edu/ Indiana University - Bloomington, USA]
* [http://www.univ-paris-diderot.fr/english/ Université Paris Diderot - Paris 7, França]
* [http://www.ufrgs.br/biociencias/ Instituto de Biociências da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.cbiot.ufrgs.br/ Centro de Biotecnologia da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.inf.ufrgs.br/ Instituto de Informática da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.lps.u-psud.fr/ Laboratoire de Physique des Solides de Orsay, França]
* [http://www.uergs.edu.br/ UERGS]
* [http://www.uff.br/ UFF]
* [http://www.ufpe.br/ufpenova/ UFPE]
* [http://www.ufpr.br/portalufpr/ UFPR]
* [http://www.biologie.ens.fr/eceem/ Eco-Evolution Mathématique (IBENS, Paris) ]

== [[Journal Club]] ==

* PDF do seminario apresentado por Daniel Gamermann dia 25/5/2016:
[http://lief.if.ufrgs.br/pub/seminars/mtc/jorn.pdf 42-O Universo a vida e tudo mais]
[http://lief.if.ufrgs.br/pub/seminars/mtc/Phanerozoic_Biodiversity.svg.png Diversidade da vida no eon Fanerozóico]

== [[Reunioes ]] ==
- 06/07 -

Journal Club - Vitor Sudbrack - Redes, Vulnerabilidade e Teoria de Percolacao

Presentes:

Aline,
Daniel,
Guilherme,
Leonardo,
Mendeli,
Paulo,
Vitor

== Softwares ==

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/viacomplex/ Via Complex]
* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/transcriptogramer/ Transcriptogramer]
== Curso Cuda ==

* [http://docs.nvidia.com/cuda/ Documentação disponível]

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/Cuda/ Curso IF-UFRGS - 2014/1]

== Getting started ==
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:Configuration_settings Configuration settings list]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:FAQ MediaWiki FAQ]
* [http://mail.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce MediaWiki release mailing list]

Consult the [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents User's Guide] for information on using the wiki software.

<big>'''MediaWiki instalado com sucesso.'''</big>

Consulte o [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents Manual de Usuário] para informações de como usar o software wiki.

== Começando ==

* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:Configuration_settings Lista de opções de configuração]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:FAQ FAQ do MediaWiki]
* [https://lists.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce Lista de discussão com avisos de novas versões do MediaWiki]

Página principal

2016-07-06T16:08:12Z

Leon: /* 06/07 */

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2016-07-06T16:03:13Z

Leon: /* 06/07 */

''''''GRUPO DE MODELOS TEÓRICOS E COMPUTACIONAIS E LABORATÓRIO DE ESTRUTURAS CELULARES''''''

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Instituto de Física - IF
Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS
PO Box 15051, 90501-970 Porto Alegre (RS), Brazil
Telephone: 55 (51) 3308-7251 - Fax: 55 (51) 3308-1762

O grupo trabalha com modelagem computacional em sistemas extensos físicos e biológicos tais como espumas, estruturas celulares e dinâmica de epidemias. Há também linhas ativas em dinâmica de informação em redes: redes metabólicas e sua evolução, redes de neurônios, redes sociais e econofísica.

=== Pesquisadores Efetivos ===

* Daniel Gamermann
* Gilberto de Lima Thomas
* [http://pcleon.if.ufrgs.br Leonardo Gregory Brunnet]
* Mendeli Vainstein
* [[Rita M. C. Almeida]]

=== Colaboradores ===

* [http://www.ufsm.br/pgfisica/professor/mombach.html José Carlos Merino Mombach (UFPampa/UFSM)]
* [http://www.if.ufrgs.br/~iglesias/JRIglesias_br.html José Roberto Iglesias (IF-UFRGS)]
* [http://www.if.ufrgs.br/cbrito/index.html Carolina Brito]
* [http://www.if.ufrgs.br/~arenzon Jeferson Arenzon]
* Raquel Giulian
* Rubem Erichsen Jr
* [http://www.if.ufrgs.br/~sgonc Sebastián Gonçalves]

=== Post-Docs ===
* Carine Beatrici

=== Estudantes Doutorado ===

* Beatriz Mizusaki
* Gabriel Perrone
* Ismael Fortuna
* Ricardo Melo Ferreira
* Samoel Renan Mello da Silva

=== Estudantes Mestrado ===
* Alessandra Friederich Lutz
* Eduarda Susin
* Juliano Gianlupi

=== Estudantes Iniciação Científica ===

* Aline Friederich Lütz
* Caroline Schmidt
* Cássio Kirch
* João Medeiros Dinis
* Paulo Casagrande Godolphim
* Pedro Inocêncio Rodrigues Terra
* Pricilla de Oliveira Henz
* Vítor Sudbrack

=== Laboratório de Estruturas Celulares ===

Dispõe de variados equipamentos destinados a experimentos de regeneração e
motilidade celular. Desde 2004
diferentes linhagens de culturas de Hidras: normais, verdes ou geneticamente modificadas para fluorescer.
Equipamentos: microscopia
de campo claro, de contraste de fase e de fluorescência integrados a
um sistema de aquisição de dados feito no IF, estufa de CO2 para
manutenção de cultura de células, centrífuga, autoclave, banho Maria
termostático, Phgâmetro, capela de fluxo laminar bem como um sistema
de computadores para controle e análise de experimentos

== Linhas de Pesquisa ==

* [[Segregação Celular]]
* [[Difusão e Armazenamento de Informação no Hipercubo: Redes Neurais e o Sistema Imunológico]]
* [[Difusão de Substâncias Químicas em Estruturas Celulares]]
* [[Dinâmica de Epidemias]]
* [[Laboratório de Estruturas Celulares]]
* [[Redes Aleatórias de Neurônios com Ruído]]
* [[Transição de vidro e propriedades de sólidos amorfos]]
* [[Espumas]]
* [[Estudo sobre as equações mestras para redes que crescem]]

== Intercâmbio Científico ==

* [http://cabfst28.cnea.gov.ar/~statisticalphysics/ Centro Atómico Bariloche - Argentina]
* [http://www.cea.fr/ Commissariat a l'Energie Atomique, Saclay, França]
* [http://www.iub.edu/ Indiana University - Bloomington, USA]
* [http://www.univ-paris-diderot.fr/english/ Université Paris Diderot - Paris 7, França]
* [http://www.ufrgs.br/biociencias/ Instituto de Biociências da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.cbiot.ufrgs.br/ Centro de Biotecnologia da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.inf.ufrgs.br/ Instituto de Informática da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.lps.u-psud.fr/ Laboratoire de Physique des Solides de Orsay, França]
* [http://www.uergs.edu.br/ UERGS]
* [http://www.uff.br/ UFF]
* [http://www.ufpe.br/ufpenova/ UFPE]
* [http://www.ufpr.br/portalufpr/ UFPR]
* [http://www.biologie.ens.fr/eceem/ Eco-Evolution Mathématique (IBENS, Paris) ]

== [[Journal Club]] ==

* PDF do seminario apresentado por Daniel Gamermann dia 25/5/2016:
[http://lief.if.ufrgs.br/pub/seminars/mtc/jorn.pdf 42-O Universo a vida e tudo mais]
[http://lief.if.ufrgs.br/pub/seminars/mtc/Phanerozoic_Biodiversity.svg.png Diversidade da vida no eon Fanerozóico]

== [[Reunioes ]] ==
= 06/07 =

Journal Club - Vitor Sudbrack - Redes, Vulnerabilidade e Teoria de Percolacao

Presentes:

Aline
Daniel
Leonardo
Mendeli
Paulo
Vitor

== Softwares ==

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/viacomplex/ Via Complex]
* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/transcriptogramer/ Transcriptogramer]
== Curso Cuda ==

* [http://docs.nvidia.com/cuda/ Documentação disponível]

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/Cuda/ Curso IF-UFRGS - 2014/1]

== Getting started ==
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:Configuration_settings Configuration settings list]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:FAQ MediaWiki FAQ]
* [http://mail.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce MediaWiki release mailing list]

Consult the [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents User's Guide] for information on using the wiki software.

<big>'''MediaWiki instalado com sucesso.'''</big>

Consulte o [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents Manual de Usuário] para informações de como usar o software wiki.

== Começando ==

* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:Configuration_settings Lista de opções de configuração]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:FAQ FAQ do MediaWiki]
* [https://lists.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce Lista de discussão com avisos de novas versões do MediaWiki]

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2016-07-06T16:00:59Z

Leon: /* Reunioes */

''''''GRUPO DE MODELOS TEÓRICOS E COMPUTACIONAIS E LABORATÓRIO DE ESTRUTURAS CELULARES''''''

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Instituto de Física - IF
Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS
PO Box 15051, 90501-970 Porto Alegre (RS), Brazil
Telephone: 55 (51) 3308-7251 - Fax: 55 (51) 3308-1762

O grupo trabalha com modelagem computacional em sistemas extensos físicos e biológicos tais como espumas, estruturas celulares e dinâmica de epidemias. Há também linhas ativas em dinâmica de informação em redes: redes metabólicas e sua evolução, redes de neurônios, redes sociais e econofísica.

=== Pesquisadores Efetivos ===

* Daniel Gamermann
* Gilberto de Lima Thomas
* [http://pcleon.if.ufrgs.br Leonardo Gregory Brunnet]
* Mendeli Vainstein
* [[Rita M. C. Almeida]]

=== Colaboradores ===

* [http://www.ufsm.br/pgfisica/professor/mombach.html José Carlos Merino Mombach (UFPampa/UFSM)]
* [http://www.if.ufrgs.br/~iglesias/JRIglesias_br.html José Roberto Iglesias (IF-UFRGS)]
* [http://www.if.ufrgs.br/cbrito/index.html Carolina Brito]
* [http://www.if.ufrgs.br/~arenzon Jeferson Arenzon]
* Raquel Giulian
* Rubem Erichsen Jr
* [http://www.if.ufrgs.br/~sgonc Sebastián Gonçalves]

=== Post-Docs ===
* Carine Beatrici

=== Estudantes Doutorado ===

* Beatriz Mizusaki
* Gabriel Perrone
* Ismael Fortuna
* Ricardo Melo Ferreira
* Samoel Renan Mello da Silva

=== Estudantes Mestrado ===
* Alessandra Friederich Lutz
* Eduarda Susin
* Juliano Gianlupi

=== Estudantes Iniciação Científica ===

* Aline Friederich Lütz
* Caroline Schmidt
* Cássio Kirch
* João Medeiros Dinis
* Paulo Casagrande Godolphim
* Pedro Inocêncio Rodrigues Terra
* Pricilla de Oliveira Henz
* Vítor Sudbrack

=== Laboratório de Estruturas Celulares ===

Dispõe de variados equipamentos destinados a experimentos de regeneração e
motilidade celular. Desde 2004
diferentes linhagens de culturas de Hidras: normais, verdes ou geneticamente modificadas para fluorescer.
Equipamentos: microscopia
de campo claro, de contraste de fase e de fluorescência integrados a
um sistema de aquisição de dados feito no IF, estufa de CO2 para
manutenção de cultura de células, centrífuga, autoclave, banho Maria
termostático, Phgâmetro, capela de fluxo laminar bem como um sistema
de computadores para controle e análise de experimentos

== Linhas de Pesquisa ==

* [[Segregação Celular]]
* [[Difusão e Armazenamento de Informação no Hipercubo: Redes Neurais e o Sistema Imunológico]]
* [[Difusão de Substâncias Químicas em Estruturas Celulares]]
* [[Dinâmica de Epidemias]]
* [[Laboratório de Estruturas Celulares]]
* [[Redes Aleatórias de Neurônios com Ruído]]
* [[Transição de vidro e propriedades de sólidos amorfos]]
* [[Espumas]]
* [[Estudo sobre as equações mestras para redes que crescem]]

== Intercâmbio Científico ==

* [http://cabfst28.cnea.gov.ar/~statisticalphysics/ Centro Atómico Bariloche - Argentina]
* [http://www.cea.fr/ Commissariat a l'Energie Atomique, Saclay, França]
* [http://www.iub.edu/ Indiana University - Bloomington, USA]
* [http://www.univ-paris-diderot.fr/english/ Université Paris Diderot - Paris 7, França]
* [http://www.ufrgs.br/biociencias/ Instituto de Biociências da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.cbiot.ufrgs.br/ Centro de Biotecnologia da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.inf.ufrgs.br/ Instituto de Informática da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.lps.u-psud.fr/ Laboratoire de Physique des Solides de Orsay, França]
* [http://www.uergs.edu.br/ UERGS]
* [http://www.uff.br/ UFF]
* [http://www.ufpe.br/ufpenova/ UFPE]
* [http://www.ufpr.br/portalufpr/ UFPR]
* [http://www.biologie.ens.fr/eceem/ Eco-Evolution Mathématique (IBENS, Paris) ]

== [[Journal Club]] ==

* PDF do seminario apresentado por Daniel Gamermann dia 25/5/2016:
[http://lief.if.ufrgs.br/pub/seminars/mtc/jorn.pdf 42-O Universo a vida e tudo mais]
[http://lief.if.ufrgs.br/pub/seminars/mtc/Phanerozoic_Biodiversity.svg.png Diversidade da vida no eon Fanerozóico]

== [[Reunioes ]] ==
= 06/07 =
Journal Club - Vitor Sudbrack - Redes, Vulnerabilidade e Teoria de Percolacao
Presentes:
Aline
Daniel
Leonardo
Mendeli
Paulo
Vitor

== Softwares ==

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/viacomplex/ Via Complex]
* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/transcriptogramer/ Transcriptogramer]
== Curso Cuda ==

* [http://docs.nvidia.com/cuda/ Documentação disponível]

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/Cuda/ Curso IF-UFRGS - 2014/1]

== Getting started ==
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:Configuration_settings Configuration settings list]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:FAQ MediaWiki FAQ]
* [http://mail.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce MediaWiki release mailing list]

Consult the [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents User's Guide] for information on using the wiki software.

<big>'''MediaWiki instalado com sucesso.'''</big>

Consulte o [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents Manual de Usuário] para informações de como usar o software wiki.

== Começando ==

* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:Configuration_settings Lista de opções de configuração]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:FAQ FAQ do MediaWiki]
* [https://lists.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce Lista de discussão com avisos de novas versões do MediaWiki]

Reunioes

2016-07-04T16:20:37Z

Leon: /* 04/06 */

=04/06=

Cassio - Debugando o programa, problema do sinal da forca

Vitor - Rodando para tempos longos, descobriu o NaN que limitava a expansao

Juliano - Rodando as simulacoes do cilindro com duas bolhas.

Joao - Terminando bem o semestre.

Paulo - Mostrou o algoritmo do rotacional.

Mendeli - Tentando fazer o filme e programando o proximo experimento.

Reunioes

2016-07-04T16:20:00Z

Leon: Criou página com '=04/06= Cassio - Debugando o programa, problema do sinal da forca Vitor - Rodando para tempos longos, descobriu o NaN que limitava a expansao Juliano - Rodando as simulacoe...'

2016-03-11T16:12:13Z

Leon: /* Estudantes Iniciação Científica */

'''GRUPO DE MODELOS TEÓRICOS E COMPUTACIONAIS E LABORATÓRIO DE ESTRUTURAS CELULARES'''

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Instituto de Física - IF
Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS
PO Box 15051, 90501-970 Porto Alegre (RS), Brazil
Telephone: 55 (51) 3308-7251 - Fax: 55 (51) 3308-1762

O grupo trabalha com modelagem computacional em sistemas extensos físicos e biológicos tais como espumas, estruturas celulares e dinâmica de epidemias. Há também linhas ativas em dinâmica de informação em redes: redes metabólicas e sua evolução, redes de neurônios, redes sociais e econofísica.

=== Pesquisadores Efetivos ===

* [http://www.if.ufrgs.br/cbrito/index.html Carolina Brito]
* Daniel Gamermann
* Gilberto de Lima Thomas
* [http://www.if.ufrgs.br/~arenzon Jeferson Arenzon]
* [http://pcleon.if.ufrgs.br Leonardo Gregory Brunnet]
* [http://www.if.ufrgs.br/~idiart Marco Aurelio Pires Idiart]
* [[Rita M. C. Almeida]]
* Rubem Erichsen Jr
* [http://www.if.ufrgs.br/~sgonc Sebastián Gonçalves]

=== Colaboradores ===

* [http://www.ufsm.br/pgfisica/professor/mombach.html José Carlos Merino Mombach (UFPampa/UFSM)]
* [http://www.if.ufrgs.br/~iglesias/JRIglesias_br.html José Roberto Iglesias (IF-UFRGS)]

=== Post-Docs ===

=== Estudantes Doutorado ===

* Beatriz Mizusaki
* Gabriel Perrone
* Ismael Fortuna
* Ricardo Melo Ferreira

=== Estudantes Mestrado ===
* Alessandra Friederich Lutz
* Eduarda Susin
* Juliano Gianlupi

=== Estudantes Iniciação Científica ===

* Aline Friederich Lütz
* Cássio Kirch
* João Medeiros Dinis
* Paulo Casagrande Godolphim
* Pricilla de Oliveira Henz
* Vitor Sudbrack

=== Laboratório de Estruturas Celulares ===

Dispõe de variados equipamentos destinados a experimentos de regeneração e
motilidade celular. Desde 2004
diferentes linhagens de culturas de Hidras: normais, verdes ou geneticamente modificadas para fluorescer.
Equipamentos: microscopia
de campo claro, de contraste de fase e de fluorescência integrados a
um sistema de aquisição de dados feito no IF, estufa de CO2 para
manutenção de cultura de células, centrífuga, autoclave, banho Maria
termostático, Phgâmetro, capela de fluxo laminar bem como um sistema
de computadores para controle e análise de experimentos

== Linhas de Pesquisa ==

* [[Segregação Celular]]
* [[Difusão e Armazenamento de Informação no Hipercubo: Redes Neurais e o Sistema Imunológico]]
* [[Difusão de Substâncias Químicas em Estruturas Celulares]]
* [[Dinâmica de Epidemias]]
* [[Laboratório de Estruturas Celulares]]
* [[Redes Aleatórias de Neurônios com Ruído]]
* [[Transição de vidro e propriedades de sólidos amorfos]]

== Intercâmbio Científico ==

* [http://cabfst28.cnea.gov.ar/~statisticalphysics/ Centro Atómico Bariloche - Argentina]
* [http://www.cea.fr/ Commissariat a l'Energie Atomique, Saclay, França]
* [http://www.iub.edu/ Indiana University - Bloomington, USA]
* [http://www.univ-paris-diderot.fr/english/ Université Paris Diderot - Paris 7, França]
* [http://www.ufrgs.br/biociencias/ Instituto de Biociências da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.cbiot.ufrgs.br/ Centro de Biotecnologia da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.inf.ufrgs.br/ Instituto de Informática da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.lps.u-psud.fr/ Laboratoire de Physique des Solides de Orsay, França]
* [http://www.uergs.edu.br/ UERGS]
* [http://www.uff.br/ UFF]
* [http://www.ufpe.br/ufpenova/ UFPE]
* [http://www.ufpr.br/portalufpr/ UFPR]

== [[Journal Club]] ==

== Softwares ==

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/viacomplex/ Via Complex]
* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/transcriptogramer/ Transcriptogramer]
== Curso Cuda ==

* [http://docs.nvidia.com/cuda/ Documentação disponível]

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/Cuda/ Curso IF-UFRGS - 2014/1]

== Getting started ==
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:Configuration_settings Configuration settings list]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:FAQ MediaWiki FAQ]
* [http://mail.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce MediaWiki release mailing list]

Consult the [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents User's Guide] for information on using the wiki software.

<big>'''MediaWiki instalado com sucesso.'''</big>

Consulte o [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents Manual de Usuário] para informações de como usar o software wiki.

== Começando ==

* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:Configuration_settings Lista de opções de configuração]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:FAQ FAQ do MediaWiki]
* [https://lists.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce Lista de discussão com avisos de novas versões do MediaWiki]

Arquivo:00719.jpg

2016-03-09T23:29:45Z

Leon:

Segregação Celular

2016-03-09T23:28:33Z

Leon:

== ''' Modelagem de segregação celular: animóides''' ==

A partir da caracterização experimental da difusão celular como o mecanismo responsável pela segrega
ção por Holtfreter em 1944 (Holtfreter1944) iniciou-se a discussão sobre a natureza desta difusão. E
ntre as várias hipóteses levantadas, a “Hipótese da Adesão Diferenciada” (HAD), proposta em 1962 por
M. S. Steinberg (Steinber1962), é a mais aceita atualmente. Segundo ela, dois ingredientes básicos regulam a segregação: motilidade e diferentes graus de adesão. Ao se difundirem devido à motilidade, a
s células mais adesivas acabam formando um agregado central, com as células do tecido menos adesivo
ficando no entorno.

A simplicidade da hipótese é tentadora e levou à busca da origem da motilidade e das diferenças nas
adesividades. Experimentos recentes confirmam alguns dos postulados da HAD: medidas de tensão superfici al
em tecidos de embrião de aves (Foty1994) e a determinação da intensidade das forças de adesão entre
pares de células de ''Hydra'' (Sato1994) confirmam as magnitudes das forças necessárias para o envolvimento
dos tecidos. Além disso, várias caracterizações experimentais relacionadas com a difusão
celular foram feitas: movimento celular induzido por flutuação da membrana celular (Mombach1995), movimento
coerente de grupos de células (Rieu1998) e tempos característicos de aprisionamento diferenciados
por tecido(Rieu2000).

Esses resultados permitem-nos projetar modelagens computacionais quantitativas ou, pelo menos, semi-quantitativas.
Neste contexto, Graner e Glazier(Graner1992) introduziram as primeiras simulações usando o
modelo GGH(Glazier2006) e mostraram que a segregação pode ocorrer com as células mais adesivas sendo
envolvidas pelas menos adesivas. No entanto, esta abordagem, além de ter sido feita apenas em duas dime
nsões, não leva em consideração os movimentos coerentes de grupos de células constatados experiment
almente, ou seja, não considera interações dependentes de velocidade.

Nessa linha investigamos a dinâmica de segregação de células gerada a partir da competição entre os diversos mecanismos
constatados experimentalmente: adesão diferencial, difusão browniana e movimentos coerentes de grupos de células. As questões
aí formuladas são as seguintes: Existe universalidade associada ao processo de crescimento e segregação? Para que
conjunto de parâmetros? Há alguma escala de tempo/tamanho onde um ou outro dos mecanismos domina?

A resposta a essas perguntas passa pela construção de ferramentas de simulação e análise. De fato, todos os mecanismos
detectados experimentalmente podem ser incluídos em modelos de partículas auto-propelentes - animóides - que se tornaram
conhecidos não apenas na descrição de movimentos de grupos de animais(Vicsek1995), mas também na dinâmica de banhos de
bactérias(Wu2000,Sokolov2007), em colônias de amebas e bactérias (Benjacob1995, Rieu2005), ou ainda em grupos de células
movendo-se em um substrato, como melanócitos (Gruler1999).

Nossos trabalhos iniciam com a construção ''ab initio'' de programas, em colaboração com H. Chaté do CEA-Saclay, visand
o o estudo em duas dimensões de segregação celular em células de hidra e na construção do diagrama de fases do sistema
com dois tipos distintos de animóides (Belmonte2007, Belmonte2008). Estamos buscando as relações entre parâmetros que p
ropiciem a segregação, as escalas espaço-temporais onde ela ocorre e a existência, ou não, de universalidade no fenôme
no. A mesma busca será feita em três dimensões quando a comparação com experimentos torna-se possível. Na parte experi
mental contamos com a colaboração de J. P. Rieu da Université Claude Bernard de Lyon.

As perguntas a serem respondida são

# Como termos de interação dependentes de velocidade influenciam a segregação?
# Como se dá a evolução espaço-temporal da segregação?
# Como os resultados das simulações comparam-se com os dados experimentais?

Pesquisadores: Leonardo G. Brunnet, Gilberto Lima Thomas e Rita M.C. de Almeida

Estudantes: Carine Beatrici, Aline Lütz, Cássio Kirch

Colaboradores externos: Jean Paul Rieu, Hugues Chaté

[[File:00719.jpg|Hidra Segregando]]

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2015-05-26T21:25:25Z

Leon: /* Laboratório de Estruturas Celulares */

'''GRUPO DE MODELOS TEÓRICOS E COMPUTACIONAIS E LABORATÓRIO DE ESTRUTURAS CELULARES'''

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Instituto de Física - IF
Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS
PO Box 15051, 90501-970 Porto Alegre (RS), Brazil
Telephone: 55 (51) 3308-7251 - Fax: 55 (51) 3308-1762

O grupo trabalha com modelagem computacional em sistemas extensos físicos e biológicos tais como espumas, estruturas celulares e dinâmica de epidemias. Há também linhas ativas em dinâmica de informação em redes: redes metabólicas e sua evolução, redes de neurônios, redes sociais e econofísica.

=== Pesquisadores Efetivos ===

* [http://www.if.ufrgs.br/cbrito/index.html Carolina Brito]
* Daniel Stariolo
* [http://www.if.ufrgs.br/~arenzon Jeferson Arenzon]
* Gilberto de Lima Thomas
* [http://pcleon.if.ufrgs.br Leonardo Gregory Brunnet]
* [http://www.if.ufrgs.br/~idiart Marco Aurelio Pires Idiart]
* [[Rita M. C. Almeida]]
* [http://www.if.ufrgs.br/~sgonc Sebastián Gonçalves]
* Rubem Erichsen Jr
* Sérgio R. Souza

=== Colaboradores ===

* [http://www.ufsm.br/pgfisica/professor/mombach.html José Carlos Merino Mombach (UFPampa/UFSM)]
* [http://www.if.ufrgs.br/~iglesias/JRIglesias_br.html José Roberto Iglesias (IF-UFRGS)]

=== Post-Docs ===

=== Estudantes Doutorado ===

* Beatriz Mizusaki
* Gabriel Perrone
* Isabela Berger
* Ismael Fortuna
* Ricardo Melo Ferreira

=== Estudantes Mestrado ===
* Alessandra Friederich Lutz
* Eduarda Susin

=== Estudantes Iniciação Científica ===

* Aline Friederich Lutz
* Cássio Kirch
* Juliano Gianlupi

=== Laboratório de Estruturas Celulares ===

Dispõe de variados equipamentos destinados a experimentos de regeneração e
motilidade celular. Desde 2004
diferentes linhagens de culturas de Hidras: normais, verdes ou geneticamente modificadas para fluorescer.
Equipamentos: microscopia
de campo claro, de contraste de fase e de fluorescência integrados a
um sistema de aquisição de dados feito no IF, estufa de CO2 para
manutenção de cultura de células, centrífuga, autoclave, banho Maria
termostático, Phgâmetro, capela de fluxo laminar bem como um sistema
de computadores para controle e análise de experimentos

== Linhas de Pesquisa ==

* [[Difusão e Armazenamento de Informação no Hipercubo: Redes Neurais e o Sistema Imunológico]]
* [[Difusão de Substâncias Químicas em Estruturas Celulares]]
* [[Dinâmica de Epidemias]]
* [[Laboratório de Estruturas Celulares]]
* [[Redes Aleatórias de Neurônios com Ruído]]
* [[Transição de vidro e propriedades de sólidos amorfos]]
* [[Segregação Celular]]

== Intercâmbio Científico ==

* [http://cabfst28.cnea.gov.ar/~statisticalphysics/ Centro Atómico Bariloche - Argentina]
* [http://www.cea.fr/ Commissariat a l'Energie Atomique, Saclay, França]
* [http://www.ufrgs.br/biociencias/ Instituto de Biociências da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.inf.ufrgs.br/ Instituto de Informática da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.lps.u-psud.fr/ Laboratoire de Physique des Solides de Orsay, França]
* [http://www.uergs.edu.br/ UERGS]
* [http://www.uff.br/ UFF]
* [http://www.ufpe.br/ufpenova/ UFPE]
* [http://www.ufpr.br/portalufpr/ UFPR]
* [http://www.nd.edu/ University of Notre Dame, USA]
* [http://www.ujf-grenoble.fr/ Université Joseph-Fourier, França]

== Softwares ==

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/viacomplex/ Via Complex]

== Curso Cuda ==

* [http://docs.nvidia.com/cuda/ Documentação disponível]

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/Cuda/ Curso IF-UFRGS - 2014/1]

== Getting started ==
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:Configuration_settings Configuration settings list]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:FAQ MediaWiki FAQ]
* [http://mail.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce MediaWiki release mailing list]

Consult the [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents User's Guide] for information on using the wiki software.

<big>'''MediaWiki instalado com sucesso.'''</big>

Consulte o [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents Manual de Usuário] para informações de como usar o software wiki.

== Começando ==

* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:Configuration_settings Lista de opções de configuração]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:FAQ FAQ do MediaWiki]
* [https://lists.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce Lista de discussão com avisos de novas versões do MediaWiki]

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2015-05-26T21:24:50Z

Leon: /* Equipes e Funções no Laboratório */

'''GRUPO DE MODELOS TEÓRICOS E COMPUTACIONAIS E LABORATÓRIO DE ESTRUTURAS CELULARES'''

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Instituto de Física - IF
Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS
PO Box 15051, 90501-970 Porto Alegre (RS), Brazil
Telephone: 55 (51) 3308-7251 - Fax: 55 (51) 3308-1762

O grupo trabalha com modelagem computacional em sistemas extensos físicos e biológicos tais como espumas, estruturas celulares e dinâmica de epidemias. Há também linhas ativas em dinâmica de informação em redes: redes metabólicas e sua evolução, redes de neurônios, redes sociais e econofísica.

=== Pesquisadores Efetivos ===

* [http://www.if.ufrgs.br/cbrito/index.html Carolina Brito]
* Daniel Stariolo
* [http://www.if.ufrgs.br/~arenzon Jeferson Arenzon]
* Gilberto de Lima Thomas
* [http://pcleon.if.ufrgs.br Leonardo Gregory Brunnet]
* [http://www.if.ufrgs.br/~idiart Marco Aurelio Pires Idiart]
* [[Rita M. C. Almeida]]
* [http://www.if.ufrgs.br/~sgonc Sebastián Gonçalves]
* Rubem Erichsen Jr
* Sérgio R. Souza

=== Colaboradores ===

* [http://www.ufsm.br/pgfisica/professor/mombach.html José Carlos Merino Mombach (UFPampa/UFSM)]
* [http://www.if.ufrgs.br/~iglesias/JRIglesias_br.html José Roberto Iglesias (IF-UFRGS)]

=== Post-Docs ===

=== Estudantes Doutorado ===

* Beatriz Mizusaki
* Gabriel Perrone
* Isabela Berger
* Ismael Fortuna
* Ricardo Melo Ferreira

=== Estudantes Mestrado ===
* Alessandra Friederich Lutz
* Eduarda Susin

=== Estudantes Iniciação Científica ===

* Aline Friederich Lutz
* Cássio Kirch
* Juliano Gianlupi

=== Laboratório de Estruturas Celulares ===

Dispõe de variados equipamentos destinados a experimentos de regeneração e
motilidade celular. Desde 2004
diferentes linhagens de culturas de Hidras: normais, verdes ou geneticamente modificadas para fluorescer.
Equipamentos: microscopia
de campo claro, de contraste de fase e de fluorescência integrados a
um sistema de aquisição de dados feito no IF, estufa de CO$_2$ para
manutenção de cultura de células, centrífuga, autoclave, banho Maria
termostático, Phgâmetro, capela de fluxo laminar bem como um sistema
de computadores para controle e análise de experimentos

== Linhas de Pesquisa ==

* [[Difusão e Armazenamento de Informação no Hipercubo: Redes Neurais e o Sistema Imunológico]]
* [[Difusão de Substâncias Químicas em Estruturas Celulares]]
* [[Dinâmica de Epidemias]]
* [[Laboratório de Estruturas Celulares]]
* [[Redes Aleatórias de Neurônios com Ruído]]
* [[Transição de vidro e propriedades de sólidos amorfos]]
* [[Segregação Celular]]

== Intercâmbio Científico ==

* [http://cabfst28.cnea.gov.ar/~statisticalphysics/ Centro Atómico Bariloche - Argentina]
* [http://www.cea.fr/ Commissariat a l'Energie Atomique, Saclay, França]
* [http://www.ufrgs.br/biociencias/ Instituto de Biociências da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.inf.ufrgs.br/ Instituto de Informática da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.lps.u-psud.fr/ Laboratoire de Physique des Solides de Orsay, França]
* [http://www.uergs.edu.br/ UERGS]
* [http://www.uff.br/ UFF]
* [http://www.ufpe.br/ufpenova/ UFPE]
* [http://www.ufpr.br/portalufpr/ UFPR]
* [http://www.nd.edu/ University of Notre Dame, USA]
* [http://www.ujf-grenoble.fr/ Université Joseph-Fourier, França]

== Softwares ==

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/viacomplex/ Via Complex]

== Curso Cuda ==

* [http://docs.nvidia.com/cuda/ Documentação disponível]

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/Cuda/ Curso IF-UFRGS - 2014/1]

== Getting started ==
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:Configuration_settings Configuration settings list]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:FAQ MediaWiki FAQ]
* [http://mail.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce MediaWiki release mailing list]

Consult the [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents User's Guide] for information on using the wiki software.

<big>'''MediaWiki instalado com sucesso.'''</big>

Consulte o [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents Manual de Usuário] para informações de como usar o software wiki.

== Começando ==

* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:Configuration_settings Lista de opções de configuração]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:FAQ FAQ do MediaWiki]
* [https://lists.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce Lista de discussão com avisos de novas versões do MediaWiki]

Rita M. C. Almeida

2014-11-13T19:01:25Z

Leon: Limpou toda a página

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2014-11-13T19:00:18Z

Leon: /* Pesquisadores Efetivos */

'''GRUPO DE MODELOS TEÓRICOS E COMPUTACIONAIS E LABORATÓRIO DE ESTRUTURAS CELULARES'''

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Instituto de Física - IF
Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS
PO Box 15051, 90501-970 Porto Alegre (RS), Brazil
Telephone: 55 (51) 3308-7251 - Fax: 55 (51) 3308-1762

O grupo trabalha com modelagem computacional em sistemas extensos físicos e biológicos tais como espumas, estruturas celulares e dinâmica de epidemias. Há também linhas ativas em dinâmica de informação em redes: redes metabólicas e sua evolução, redes de neurônios, redes sociais e econofísica.

=== Pesquisadores Efetivos ===

* [http://www.if.ufrgs.br/cbrito/index.html Carolina Brito]
* Daniel Stariolo
* [http://www.if.ufrgs.br/~arenzon Jeferson Arenzon]
* Gilberto de Lima Thomas
* [http://pcleon.if.ufrgs.br Leonardo Gregory Brunnet]
* [http://www.if.ufrgs.br/~idiart Marco Aurelio Pires Idiart]
* [[Rita M. C. Almeida]]
* [http://www.if.ufrgs.br/~sgonc Sebastián Gonçalves]
* Rubem Erichsen Jr
* Sérgio R. Souza

=== Colaboradores ===

* [http://www.ufsm.br/pgfisica/professor/mombach.html José Carlos Merino Mombach (UFPampa/UFSM)]
* [http://www.if.ufrgs.br/~iglesias/JRIglesias_br.html José Roberto Iglesias (IF-UFRGS)]

=== Post-Docs ===

=== Estudantes Doutorado ===

* Beatriz Mizusaki
* Gabriel Perrone
* Isabela Berger
* Ismael Fortuna
* Ricardo Melo Ferreira

=== Estudantes Mestrado ===
* Alessandra Friederich Lutz
* Eduarda Susin

=== Estudantes Iniciação Científica ===

* Aline Friederich Lutz
* Vinicius Moraes Faria
* Juliano Gianlupi

=== Equipes e Funções no Laboratório ===

* Aline, Isabela e Rodolfo - Manutenção de equipamentos.
* Jason - Autoclave e soluções , almoxarifado e estoque.

== Linhas de Pesquisa ==

* [[Difusão e Armazenamento de Informação no Hipercubo: Redes Neurais e o Sistema Imunológico]]
* [[Difusão de Substâncias Químicas em Estruturas Celulares]]
* [[Dinâmica de Epidemias]]
* [[Hydras e o Laboratório de Estruturas Celulares]]
* [[Redes Aleatórias de Neurônios com Ruído]]
* [[Transição de vidro e propriedades de sólidos amorfos]]

== Intercâmbio Científico ==

* [http://cabfst28.cnea.gov.ar/~statisticalphysics/ Centro Atómico Bariloche - Argentina]
* [http://www.cea.fr/ Commissariat a l'Energie Atomique, Saclay, França]
* [http://www.ufrgs.br/biociencias/ Instituto de Biociências da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.inf.ufrgs.br/ Instituto de Informática da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.lps.u-psud.fr/ Laboratoire de Physique des Solides de Orsay, França]
* [http://www.uergs.edu.br/ UERGS]
* [http://www.uff.br/ UFF]
* [http://www.ufpe.br/ufpenova/ UFPE]
* [http://www.ufpr.br/portalufpr/ UFPR]
* [http://www.nd.edu/ University of Notre Dame, USA]
* [http://www.ujf-grenoble.fr/ Université Joseph-Fourier, França]

== Softwares ==

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/viacomplex/ Via Complex]

== Curso Cuda ==

* [http://docs.nvidia.com/cuda/ Documentação disponível]

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/Cuda/ Curso IF-UFRGS - 2014/1]

== Getting started ==
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:Configuration_settings Configuration settings list]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:FAQ MediaWiki FAQ]
* [http://mail.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce MediaWiki release mailing list]

Consult the [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents User's Guide] for information on using the wiki software.

<big>'''MediaWiki instalado com sucesso.'''</big>

Consulte o [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents Manual de Usuário] para informações de como usar o software wiki.

== Começando ==

* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:Configuration_settings Lista de opções de configuração]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:FAQ FAQ do MediaWiki]
* [https://lists.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce Lista de discussão com avisos de novas versões do MediaWiki]

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2014-11-13T18:57:46Z

Leon: /* Getting started */

'''GRUPO DE MODELOS TEÓRICOS E COMPUTACIONAIS E LABORATÓRIO DE ESTRUTURAS CELULARES'''

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Instituto de Física - IF
Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS
PO Box 15051, 90501-970 Porto Alegre (RS), Brazil
Telephone: 55 (51) 3308-7251 - Fax: 55 (51) 3308-1762

O grupo trabalha com modelagem computacional em sistemas extensos físicos e biológicos tais como espumas, estruturas celulares e dinâmica de epidemias. Há também linhas ativas em dinâmica de informação em redes: redes metabólicas e sua evolução, redes de neurônios, redes sociais e econofísica.

=== Pesquisadores Efetivos ===

* Carolina Brito
* Daniel Stariolo
* [http://www.if.ufrgs.br/~arenzon Jeferson Arenzon]
* Gilberto de Lima Thomas
* [http://pcleon.if.ufrgs.br Leonardo Gregory Brunnet]
* [http://www.if.ufrgs.br/~idiart Marco Aurelio Pires Idiart]
* [[Rita M. C. Almeida]]
* [http://www.if.ufrgs.br/~sgonc Sebastián Gonçalves]
* Rubem Erichsen Jr
* Sérgio R. Souza

=== Colaboradores ===

* [http://www.ufsm.br/pgfisica/professor/mombach.html José Carlos Merino Mombach (UFPampa/UFSM)]
* [http://www.if.ufrgs.br/~iglesias/JRIglesias_br.html José Roberto Iglesias (IF-UFRGS)]

=== Post-Docs ===

=== Estudantes Doutorado ===

* Beatriz Mizusaki
* Gabriel Perrone
* Isabela Berger
* Ismael Fortuna
* Ricardo Melo Ferreira

=== Estudantes Mestrado ===
* Alessandra Friederich Lutz
* Eduarda Susin

=== Estudantes Iniciação Científica ===

* Aline Friederich Lutz
* Vinicius Moraes Faria
* Juliano Gianlupi

=== Equipes e Funções no Laboratório ===

* Aline, Isabela e Rodolfo - Manutenção de equipamentos.
* Jason - Autoclave e soluções , almoxarifado e estoque.

== Linhas de Pesquisa ==

* [[Difusão e Armazenamento de Informação no Hipercubo: Redes Neurais e o Sistema Imunológico]]
* [[Difusão de Substâncias Químicas em Estruturas Celulares]]
* [[Dinâmica de Epidemias]]
* [[Hydras e o Laboratório de Estruturas Celulares]]
* [[Redes Aleatórias de Neurônios com Ruído]]
* [[Transição de vidro e propriedades de sólidos amorfos]]

== Intercâmbio Científico ==

* [http://cabfst28.cnea.gov.ar/~statisticalphysics/ Centro Atómico Bariloche - Argentina]
* [http://www.cea.fr/ Commissariat a l'Energie Atomique, Saclay, França]
* [http://www.ufrgs.br/biociencias/ Instituto de Biociências da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.inf.ufrgs.br/ Instituto de Informática da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.lps.u-psud.fr/ Laboratoire de Physique des Solides de Orsay, França]
* [http://www.uergs.edu.br/ UERGS]
* [http://www.uff.br/ UFF]
* [http://www.ufpe.br/ufpenova/ UFPE]
* [http://www.ufpr.br/portalufpr/ UFPR]
* [http://www.nd.edu/ University of Notre Dame, USA]
* [http://www.ujf-grenoble.fr/ Université Joseph-Fourier, França]

== Softwares ==

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/viacomplex/ Via Complex]

== Curso Cuda ==

* [http://docs.nvidia.com/cuda/ Documentação disponível]

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/Cuda/ Curso IF-UFRGS - 2014/1]

== Getting started ==
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:Configuration_settings Configuration settings list]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:FAQ MediaWiki FAQ]
* [http://mail.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce MediaWiki release mailing list]

Consult the [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents User's Guide] for information on using the wiki software.

<big>'''MediaWiki instalado com sucesso.'''</big>

Consulte o [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents Manual de Usuário] para informações de como usar o software wiki.

== Começando ==

* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:Configuration_settings Lista de opções de configuração]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:FAQ FAQ do MediaWiki]
* [https://lists.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce Lista de discussão com avisos de novas versões do MediaWiki]

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Leon: /* Curso Cuda */

'''GRUPO DE MODELOS TEÓRICOS E COMPUTACIONAIS E LABORATÓRIO DE ESTRUTURAS CELULARES'''

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Instituto de Física - IF
Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS
PO Box 15051, 90501-970 Porto Alegre (RS), Brazil
Telephone: 55 (51) 3308-7251 - Fax: 55 (51) 3308-1762

O grupo trabalha com modelagem computacional em sistemas extensos físicos e biológicos tais como espumas, estruturas celulares e dinâmica de epidemias. Há também linhas ativas em dinâmica de informação em redes: redes metabólicas e sua evolução, redes de neurônios, redes sociais e econofísica.

=== Pesquisadores Efetivos ===

* Carolina Brito
* Daniel Stariolo
* [http://www.if.ufrgs.br/~arenzon Jeferson Arenzon]
* Gilberto de Lima Thomas
* [http://pcleon.if.ufrgs.br Leonardo Gregory Brunnet]
* [http://www.if.ufrgs.br/~idiart Marco Aurelio Pires Idiart]
* [[Rita M. C. Almeida]]
* [http://www.if.ufrgs.br/~sgonc Sebastián Gonçalves]
* Rubem Erichsen Jr
* Sérgio R. Souza

=== Colaboradores ===

* [http://www.ufsm.br/pgfisica/professor/mombach.html José Carlos Merino Mombach (UFPampa/UFSM)]
* [http://www.if.ufrgs.br/~iglesias/JRIglesias_br.html José Roberto Iglesias (IF-UFRGS)]

=== Post-Docs ===

=== Estudantes Doutorado ===

* Beatriz Mizusaki
* Gabriel Perrone
* Isabela Berger
* Ismael Fortuna
* Ricardo Melo Ferreira

=== Estudantes Mestrado ===
* Alessandra Friederich Lutz
* Eduarda Susin

=== Estudantes Iniciação Científica ===

* Aline Friederich Lutz
* Vinicius Moraes Faria
* Juliano Gianlupi

=== Equipes e Funções no Laboratório ===

* Aline, Isabela e Rodolfo - Manutenção de equipamentos.
* Jason - Autoclave e soluções , almoxarifado e estoque.

== Linhas de Pesquisa ==

* [[Difusão e Armazenamento de Informação no Hipercubo: Redes Neurais e o Sistema Imunológico]]
* [[Difusão de Substâncias Químicas em Estruturas Celulares]]
* [[Dinâmica de Epidemias]]
* [[Hydras e o Laboratório de Estruturas Celulares]]
* [[Redes Aleatórias de Neurônios com Ruído]]
* [[Transição de vidro e propriedades de sólidos amorfos]]

== Intercâmbio Científico ==

* [http://cabfst28.cnea.gov.ar/~statisticalphysics/ Centro Atómico Bariloche - Argentina]
* [http://www.cea.fr/ Commissariat a l'Energie Atomique, Saclay, França]
* [http://www.ufrgs.br/biociencias/ Instituto de Biociências da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.inf.ufrgs.br/ Instituto de Informática da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.lps.u-psud.fr/ Laboratoire de Physique des Solides de Orsay, França]
* [http://www.uergs.edu.br/ UERGS]
* [http://www.uff.br/ UFF]
* [http://www.ufpe.br/ufpenova/ UFPE]
* [http://www.ufpr.br/portalufpr/ UFPR]
* [http://www.nd.edu/ University of Notre Dame, USA]
* [http://www.ujf-grenoble.fr/ Université Joseph-Fourier, França]

== Softwares ==

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/viacomplex/ Via Complex]

== Curso Cuda ==

* [http://docs.nvidia.com/cuda/ Documentação disponível]

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/Cuda/ Curso IF-UFRGS - 2014/1]

== Getting started ==
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:Configuration_settings Configuration settings list]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:FAQ MediaWiki FAQ]
* [http://mail.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce MediaWiki release mailing list]

Consult the [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents User's Guide] for information on using the wiki software.

<big>'''MediaWiki instalado com sucesso.'''</big>

Consulte o [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents Manual de Usuário] para informações de como usar o software wiki.

== Começando ==

* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:Configuration_settings Lista de opções de configuração]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:FAQ FAQ do MediaWiki]
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2014-11-13T18:56:57Z

Leon: /* Softwares */

'''GRUPO DE MODELOS TEÓRICOS E COMPUTACIONAIS E LABORATÓRIO DE ESTRUTURAS CELULARES'''

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Instituto de Física - IF
Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS
PO Box 15051, 90501-970 Porto Alegre (RS), Brazil
Telephone: 55 (51) 3308-7251 - Fax: 55 (51) 3308-1762

O grupo trabalha com modelagem computacional em sistemas extensos físicos e biológicos tais como espumas, estruturas celulares e dinâmica de epidemias. Há também linhas ativas em dinâmica de informação em redes: redes metabólicas e sua evolução, redes de neurônios, redes sociais e econofísica.

=== Pesquisadores Efetivos ===

* Carolina Brito
* Daniel Stariolo
* [http://www.if.ufrgs.br/~arenzon Jeferson Arenzon]
* Gilberto de Lima Thomas
* [http://pcleon.if.ufrgs.br Leonardo Gregory Brunnet]
* [http://www.if.ufrgs.br/~idiart Marco Aurelio Pires Idiart]
* [[Rita M. C. Almeida]]
* [http://www.if.ufrgs.br/~sgonc Sebastián Gonçalves]
* Rubem Erichsen Jr
* Sérgio R. Souza

=== Colaboradores ===

* [http://www.ufsm.br/pgfisica/professor/mombach.html José Carlos Merino Mombach (UFPampa/UFSM)]
* [http://www.if.ufrgs.br/~iglesias/JRIglesias_br.html José Roberto Iglesias (IF-UFRGS)]

=== Post-Docs ===

=== Estudantes Doutorado ===

* Beatriz Mizusaki
* Gabriel Perrone
* Isabela Berger
* Ismael Fortuna
* Ricardo Melo Ferreira

=== Estudantes Mestrado ===
* Alessandra Friederich Lutz
* Eduarda Susin

=== Estudantes Iniciação Científica ===

* Aline Friederich Lutz
* Vinicius Moraes Faria
* Juliano Gianlupi

=== Equipes e Funções no Laboratório ===

* Aline, Isabela e Rodolfo - Manutenção de equipamentos.
* Jason - Autoclave e soluções , almoxarifado e estoque.

== Linhas de Pesquisa ==

* [[Difusão e Armazenamento de Informação no Hipercubo: Redes Neurais e o Sistema Imunológico]]
* [[Difusão de Substâncias Químicas em Estruturas Celulares]]
* [[Dinâmica de Epidemias]]
* [[Hydras e o Laboratório de Estruturas Celulares]]
* [[Redes Aleatórias de Neurônios com Ruído]]
* [[Transição de vidro e propriedades de sólidos amorfos]]

== Intercâmbio Científico ==

* [http://cabfst28.cnea.gov.ar/~statisticalphysics/ Centro Atómico Bariloche - Argentina]
* [http://www.cea.fr/ Commissariat a l'Energie Atomique, Saclay, França]
* [http://www.ufrgs.br/biociencias/ Instituto de Biociências da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.inf.ufrgs.br/ Instituto de Informática da UFRGS, Rio Grande do Sul]
* [http://www.lps.u-psud.fr/ Laboratoire de Physique des Solides de Orsay, França]
* [http://www.uergs.edu.br/ UERGS]
* [http://www.uff.br/ UFF]
* [http://www.ufpe.br/ufpenova/ UFPE]
* [http://www.ufpr.br/portalufpr/ UFPR]
* [http://www.nd.edu/ University of Notre Dame, USA]
* [http://www.ujf-grenoble.fr/ Université Joseph-Fourier, França]

== Softwares ==

* [http://lief.if.ufrgs.br/pub/biosoftwares/viacomplex/ Via Complex]

== Curso Cuda ==

[http://docs.nvidia.com/cuda/ Documentação disponível]

[http://lief.if.ufrgs.br/pub/Cuda/ Curso IF-UFRGS - 2014/1]

== Getting started ==
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:Configuration_settings Configuration settings list]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Help:FAQ MediaWiki FAQ]
* [http://mail.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce MediaWiki release mailing list]

Consult the [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents User's Guide] for information on using the wiki software.

<big>'''MediaWiki instalado com sucesso.'''</big>

Consulte o [http://meta.wikimedia.org/wiki/Help:Contents Manual de Usuário] para informações de como usar o software wiki.

== Começando ==

* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:Configuration_settings Lista de opções de configuração]
* [http://www.mediawiki.org/wiki/Manual:FAQ FAQ do MediaWiki]
* [https://lists.wikimedia.org/mailman/listinfo/mediawiki-announce Lista de discussão com avisos de novas versões do MediaWiki]